茶树CsDREB2C基因的克隆、生物信息学及低温表达分析.docx

茶树CsDREB2C基因的克隆、生物信息学及低温表达分析

目录

茶树CsDREB2C基因的克隆、生物信息学及低温表达分析（1）．．．．．．3

内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景和意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.2研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.3文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.4实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.5论文结构安排．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

CsDREB2C基因的克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.1CsDREB2C基因序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.2基因克隆策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.3克隆结果验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.3.1克隆测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.3.2序列比对分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.4CsDREB2C基因序列特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

CsDREB2C基因的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.1编码蛋白分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

3.2蛋白质功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

3.3蛋白质结构预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

3.4亚细胞定位预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

3.5蛋白质相互作用分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

3.6系统进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

CsDREB2C基因在低温下的表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

4.1实验材料准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

4.2低温处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

4.3总RNA提取与反转录．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

茶树CsDREB2C基因的克隆、生物信息学及低温表达分析（2）．．．．．24

内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

茶树CsDREB2C基因的克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1基因克隆策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.2基因片段的扩增与纯化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.3克隆片段的测序与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

3.1CsDREB2C基因序列的同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.2结构域分析与功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

3.3启动子区域分析