打顶前后烟草miRNA表达谱的生物信息学分析及靶基因的电子克隆的开题报告.docx

打顶前后烟草miRNA表达谱的生物信息学分析及靶基因的电子克隆的开题报告 一、研究背景及意义 吸烟是一种普遍存在的不良健康习惯，烟草中含有丰富的化学成分，这些成分非常危害人身体健康。研究表明，烟草中的miRNA可以通过参与调控基因表达来影响人体机能，进而导致各种烟草相关疾病的发生。打顶是吸烟的一种常见方式，因此研究打顶前后烟草miRNA表达谱，可以更深入地了解烟草对人体的危害机制和相关分子生物学机制。 二、研究目的 本研究旨在通过生物信息学分析，探究打顶前后烟草miRNA的差异表达情况，从而初步了解打顶对烟草miRNA表达的影响。此外，通过miRNA的靶向预测，预测烟草miRNA对不同基因的靶向调控作用，最终进一步明确烟草对人体机能的影响机制。 三、研究内容 1.收集打顶前后的烟草样本，利用高通量测序技术建立烟草miRNA表达谱。 2.基于GO和KEGG数据库，对烟草miRNA差异表达的富集通路和生物学过程进行生物信息学分析和挖掘，寻找与烟草相关的通路和生物学过程。 3.预测差异表达的miRNA的靶基因，通过Gene Ontology (GO) 和KEGG数据库进行生物信息学分析和挖掘，从而发现相关通路、功能等。 4.利用基因电子克隆技术验证差异表达的miRNA的靶基因。 四、研究方法 1.样本采集：收集打顶前后的烟草样本。 2.高通量测序：运用高通量测序技术对样本中的miRNA进行全面检测，并建立烟草miRNA表达谱。 3.生物信息学分析：利用GO和KEGG数据库对miRNA差异表达的富集通路和生物学过程进行生物信息学分析和挖掘。 4.miRNA靶基因预测：运用多种算法预测差异表达的miRNA的靶基因，从而预测miRNA的重要生物学功能。 5.基因电子克隆：将预测得到的miRNA靶基因进行电子克隆验证，从而进一步确认miRNA的调控作用。 五、预期结果 通过本研究，我们预期可以初步探明打顶前后烟草miRNA的差异表达情况，并预测烟草miRNA的靶向调控作用及其对人体机能的影响机制。此外，通过基因电子克隆技术的验证，可以进一步确认预测得到的miRNA靶基因的调控作用，为后续深入研究奠定基础。 六、研究意义 本研究的结果有助于更深入地了解烟草对人体的危害机制及其分子生物学机制，为烟草相关疾病的预防和治疗提供理论依据。此外，本研究还可以为miRNA作为治疗靶点的开发提供一定的参考。