玉米ZmPOD基因克隆、生物信息学分析及功能验证.docx

玉米ZmPOD基因克隆、生物信息学分析及功能验证

目录

玉米ZmPOD基因克隆、生物信息学分析及功能验证（1）．．．．．．．．．．．3

内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1玉米ZmPOD基因的克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1.1基因序列检索与设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.1.2PCR扩增与克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.1.3DNA序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.2生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.2.1序列同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.2.2结构域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2.3蛋白质功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

2.3功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

2.3.1基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

2.3.2过表达与沉默实验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.3.3生物活性测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

3.1玉米ZmPOD基因的克隆与序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

3.1.1基因克隆结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.1.2序列同源性分析结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.2生物信息学分析结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

3.2.1结构域预测结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

3.2.2蛋白质功能预测结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

3.3功能验证结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

3.3.1基因表达分析结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

3.3.2过表达与沉默实验结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.3.3生物活性测定结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

玉米ZmPOD基因克隆、生物信息学分析及功能验证（2）．．．．．．．．．．30

一、内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

研究背景和意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

国内外研究现状及发展趋势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

研究目的与任务．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

二、玉米ZmPOD基因克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

玉米ZmPOD基因简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

基因组文库构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

基因克隆策略与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

克隆产物鉴定与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．