长穗偃麦草EeDREB2 基因的克隆与生物信息学分析.pdf

中国农学通报 2013,29(15): 149-156 Chinese Agricultural Science Bulletin 长穗偃麦草EeDREB2 基因的克隆与生物信息学分析 1 2 3 3 3 3 3 孙珊珊 ，杨 涛 ，柳 珊 ，陈京瑞 ，赵昌平 ，唐益苗 ，高世庆 1 2 （首都师范大学生命科学学院，北京100048；北京农学院植物科学技术学院，北京102206； 3 北京杂交小麦工程技术研究中心，北京100097） 摘 要：为了进一步研究EeDREB2 基因的结构和功能特点并为转基因小麦挖掘有效的候选基因，应用同 源克隆的方法从长穗偃麦草中克隆出EeDREB2 基因，通过生物信息学的手段对EeDREB2 基因进行初 步的分子特征分析。结果显示，该基因全长1035 bp ，编码344 个氨基酸，理论上的等电点为4.85，分子量 为37485.49 Da ，属于亲水性蛋白，有20 个磷酸化位点。亚细胞定位预测显示EeDREB2 基因定位在细 胞核中，表达谱分析预测表明EeDREB2 在根、茎、叶、花、种子中都表达，其中叶中表达量最高。同源性 分析发现，EeDREB2 与TaDREB4B 同源性最高。EeDREB2 基因的克隆为转基因小麦的抗逆性研究提 供了有效资源。 关键词：长穗偃麦草；EeDREB2 ；基因克隆；系统进化分析；亚细胞定位 中图分类号：Q37 文献标志码：A 论文编号：2012-2837 Identification and Bioinformatics Analysis of the EeDREB2 in Elytrigia elongate 1 2 3 3 3 3 3 Sun Shanshan , Yang Tao , Liu Shan , Chen Jingrui , Zhao Changping , Tang Yimiao , Gao Shiqing 1 ( CollegeofLifeScience,CapitalNormalUniversity, Beijing 100048; 2 CollegeofPlantScienceandTechnology,BeijingUniversityofAgriculture, Beijing 102206; 3BeijingEngineeringandTechniqueResearchCenterofHybridWheat, Beijing 100097) Abstract: In order to reveal the structure and functional characteristics of EeDREB2, and provide important candidate genes for transgenic wheat, the cDNA of EeDREB2 was cloned in Elytrigia elongate. The results showed that the cDNA of EeDREB2 was 1035 bp and encoded 344 amino acids, encoding a hydrophilic amino acid with 20 phosph