河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究.docx
河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究
目录
河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究（1）．．．．．．．．．．．．．3
一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
二、河北杨的生物学特性及基因组概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
河北杨的生物学特性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
河北杨基因组概况．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
河北杨基因研究的意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
三、PhMYB14基因的克隆与表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
PhMYB14基因的克隆．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
PhMYB14基因的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
PhMYB14基因的功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
四、生物信息学分析方法的介绍与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
生物信息学概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
生物信息学分析方法的分类与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
本研究中的生物信息学分析方法及流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
五、河北杨PhMYB14基因的生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
PhMYB14基因序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
PhMYB14基因的表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
PhMYB14基因的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
PhMYB14基因与其他相关基因的关系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
六、河北杨PhMYB14基因的功能研究及实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．26
PhMYB14基因的功能预测及分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
功能验证实验的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
实验结果的分析与讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
七、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
研究成果总结．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
研究限制与不足．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
未来研究方向与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
河北杨PhMYB14基因克隆与生物信息学分析研究（2）．．．．．．．．．．．．36
一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
1.2文献综述与研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37
二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
2.1实验材料准备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
2.1.1植物材料的选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41
2.1.2主要试剂及设备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42
2.2基因克隆技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
2.2.1RNA提取与cDNA合成．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44
2.2.2引物设计与PCR扩增．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
2.2.3克隆鉴定与序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46
2.3生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．