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番鸭IFN-α基因的克隆与序列分析.pdf

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福建农业学报 26(4):523~527,201l FujianJournalofAgriculturalSciences 文章编号 :1。08—0384 (2011)04—523—05 番鸭 IFN-a基因的克隆与序列分析 朱海侠 一,万春和 ,黄 瑜 ,施少华 ,程龙飞 ,傅光华 ,陈红梅 (1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福建 福州 350013;2.福建农林大学动物科学学院,福建 福州 350002) 摘 要 :采用 RT—PCR方法从番鸭肺脏器官中扩增 IFN-a基 因片段 ,将扩增产物经胶 回收后克隆到 pMD18一T 载体上,经PCR和双酶切鉴定为阳性后进行序列测定,并用Lasergenev7.1DNAStar软件对测序结果进行分析。 结果表明,所扩增 的 IFN- 基 因编码完整 的开放 阅读框 ,基 因长度 为 576bp,为 国内外 首次报道 。并与 GenBank中登录的各品种鸭、鹅 IFN-a基因核苷酸序列进行 同源性 比较分析 ,其同源性分别在 97.0 ~97.7 和 95.5 ~97.7 ;遗传进化分析表明,鸭和鹅 IFN-a基 因在遗传进化上呈各 自独立的分支 ,推测 IFN—a基 因 在不同动物 中有严格 的种属特异性 。 关键词 :番鸭;a干扰素 ;序列分析 中图分类号 :Q959.723 文献标识码 :A CloningandSequenceAnalysisofMuscovyDuck InterferonAlpha ZHU Hai—xia ,W AN Chu—he ,HUANG Yu ,SHIShao—hua ,CHENG Long—fei,FU Guang—hua ,CHEN Hong—mei (1.InstituteofAnimalHusbandryandVeterinaryMedicine,FujianAcademyofAgriculturalScience, Fuzhou,Fujian 350013,China;2.CollegeofAnimalHusbandryandVeterinaryMedicine, FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou,Fujian 350002,China) Abstract:Reversetranscription-polymerasechainreaction (RT—PCR)methodwasusedtOamplifiedtheIFN—agene fragmentfrom lungtissueofMuscovyduck,thenclonedtopMD18一T vector,thepositivecloneswereconfirmedby PCR and restriction enzyme digestion,the obtained sequencewere analyzed by the Lasergene v7.1DNAStar software.Theresultsshowedthat,theMuscovyduckIFN—dgeneencodinga576bpopen readingframe (ORF), whichwasfirstreportedintheworld.Thenucleotidehadhighersimilarityrangingfrom 95.5 tO97.7 among differentgoosespecies,also hadhighersimilarityranging from 97.0 to97.7 among differentduckspecies; however,theducksand geeseIFN— genehadits’ownphylogenticlineage,which means,theIFN—a genehad strictlyspecificity indifferentspecies. Keywords:Muscovyduck;IFN—alpha;Sequenceanalysis 干扰素 (Interferon,IFN)是细胞或机体受到 生
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