9株猪圆环病毒Ⅱ型流行毒株全基因组克隆及序列分析.pdf

维普资讯 J rG奎gAg． Bi。 i 20J0u7ne年，2600月7 文章编号 ：1008—3464 (2007)02一O1O1一O5 9株猪圆环病毒 Ⅱ型流行毒株全基因组克隆及序列分析 尹业师，黄伟坚，屈素洁，谢丽华，刘海鹏，罗廷荣， 陆芹章，余克伦，刘芳，温荣辉，廖素环 (广西大学 动物科学技术学院．广西 南宁530005) 摘要 ：参考GenBank上发表的猪圆环病毒 Ⅱ型 (porcinecircovirus2，PCV2)全基 因组序列，设计一对 引物，通过反 向PCR技术扩增 出9株PCV2流行株的全基 因，并进行 了序列测定与分析 ，结果表 明：9株PCV2 的 基 因组 全长为1768bp或1767bp，同源性 比较发现 ，本研究 的9株PCV2之间的核苷 酸 同源性为 95．6 ～1OO ，与GenBank上已发表的PCV2分离株之间的同源性为95．1 ～99．8 ，与法国和新西兰代 表株 的亲缘关系较近 ，与美国、加拿大和澳大利亚代表株 的亲缘关系较远 。所得9株PCV2的ORF2核苷酸 及其所推导的氨基酸序列同源性分别为93．1 ～1oo 和91．8 ～99．6 ，存在较大的变异 关键词 ：猪 圆环病毒 Ⅱ型；全基 因组 ；同源性 ；变异 中图分类号 ：$852．659．2；$828 文献标识码 ：A Sequencingandanalysisofgenomeof9localepidem icPCV2strains YINYe—shi，HUANGWei—jian，QU Su—jie，XIELi—hua，LIU Hai—peng，LUO Ting—rong， LU Qin—zhang，YU Ke—lun，LIU Fang，WEN Rong—hui，IIAO Su—huan (CollegeofAnimalScienceandTechnology，GuangxiUniversity，Nanning530005，China) Abstract：Accordingtothesequenceofporcinecircovirus2(PCV2)publishedinGenBank，apair ofprimerswasdesignedandamplifiedbyreversePCR．Theresultsshowedthatthecompletegenome ofeachofthenineisolateswas1768bpor1767bpinlength．Therewasa95．6 ～ 100 identityof thecompletegenomicnucleotidesamongthenineisolatesand95．1％～99．8％identityofthecomplete genomic nucleotides with the PCV2 isolates from GenBank．Comparison ofnucleotide sequence confirmedthatthenineisolateswereclosetotheisolatesfrom FranceandNew Zealand．TheORF20f thenineisolateshad93．1 to100％nucleotidesequenceidentityand91．8％ to99．6％aminoacid identity． Keywords：porcinecircovirustypeⅡ；completegenome；homology；variation． PCV2是引起断奶后仔猪多系统衰竭征 (postweaningmultisystemicwastingsyndrome，PMWS) 的主要病原体Ⅲ，它不仅可 以作为原发病因引起猪发病，更重要的是它还能够使感染猪的免疫功能受到 损害[z．s3，导致机体抵抗力下降，易遭受其他病原的并发或继发感染，使病情加重，造成 巨大经济损失。 自199