生物化学 第1章 蛋白质的结构和功能.ppt

*核糖核酸酶分子中的二级结构α-螺旋β-折叠β-转角无规卷曲*（五）模体是具有特殊功能的超二级结构在许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个有规则的二级结构组合，被称为超二级结构。基本二级结构组合：αα，βαβ，ββ。ααβββαβ*二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，称为模体(motif)。模体是具有特殊功能的超二级结构。*钙结合蛋白中结合钙离子的模体锌指结构α-螺旋-β转角（或环）-α-螺旋模体链-β转角-链模体链-β转角-α-螺旋-β转角-链模体模体常见的形式*（六）氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成?-螺旋或β-折叠，它就会出现相应的二级结构。谷氨酸、天冬氨酸天冬酰胺、亮氨酸脯氨酸(亚氨基酸,不能形成氢键）*三、在二级结构基础上多肽链进一步折叠形成蛋白质三级结构疏水键、离子键、氢键和VanderWaals力等。主要的化学键:整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。定义:（一）三级结构是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置*维系蛋白质分子构象的非共价键*肌红蛋白(Mb)N端C端*（二）结构域是三级结构层次上的局部折叠区分子量较大的蛋白质常可折叠成多个结构较为紧密的区域，并各行其功能，称为结构域(domain)。3-磷酸甘油醛脱氢酶*对那些较小的蛋白质分子来说，结构域和三级结构往往是一个意思，也就是说是单结构域的。一般来说，大的蛋白质分子可以由2个或更多个结构域组成。*（三）分子伴侣参与蛋白质折叠分子伴侣(chaperon)是通过提供一个保护环境从而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构的蛋白质。分子伴侣主要有：核糖体结合性分子伴侣非核糖体结合性分子伴侣⑴热休克蛋白(heatshockprotein,HSP)⑵伴侣蛋白(chaperonins)*分子伴侣可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随后松开，如此重复进行可防止错误的聚集发生，使肽链正确折叠。分子伴侣也可与错误聚集的肽段结合，使之解聚后，再诱导其正确折叠。分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确形成起了重要的作用。*亚基之间的缔合力主要是氢键和离子键。四、含有二条以上多肽链的蛋白质具有四级结构蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基(subunit)。*血红蛋白的四级结构（四聚体）蛋白质的一级结构是它的氨基酸序列蛋白质的二级结构是由氢键维系的肽链熵效应卷曲与折叠Primary

structureSecondary

structure小结蛋白质的三级结构是一条多肽链自然形成的三维结构蛋白质的四级结构是亚基的空间排列与缔合Polypeptide

(singlesubunit

oftransthyretin)Transthyretin,withfour

identicalpolypeptidesubunitsTertiary

structureQuaternary

structure*五、蛋白质的分类根据蛋白质组成成分:单纯蛋白质结合蛋白质=蛋白质部分+非蛋白质部分根据蛋白质形状:纤维状蛋白质球状蛋白质蛋白质结构与功能的关系

TheRelationofStructureandFunctionofProtein第三节*（一）一级结构是空间构象的基础一、蛋白质一级结构是高级结构与功能的基础牛核糖核酸酶的一级结构二硫键蛋白质的分子结构

TheMolecularStructureofProtein第二节*蛋白质的分子结构包括:高级结构一级结构(primarystructure)二级结构(secondarystructure)三级结构(tertiarystructure)四级结构(quaternarystructure)*随着蛋白质化学研究的进展，认为在二级结构和三级结构之间还可划分超二级结构和结构域两个层次，所以蛋白质的结构层次为：一级结构二级结构超二级结构结构域三级结构四级结构*除一级结构外，蛋白质的二、三、四级结构均属于空间结构，即构象（conformation）。