《微生物分类鉴定》课件 .ppt

*************************************真菌分类系统概述真菌界异养真核微生物，细胞壁含几丁质主要门类子囊菌门、担子菌门、接合菌门、壶菌门等3分子分类标记ITS区域、18SrRNA、β-微管蛋白基因等4分类系统特点结合形态学与分子系统发育，不断更新完善真菌分类系统经历了从基于形态特征的传统分类到整合分子数据的现代分类的演变过程。传统上，真菌主要根据有性生殖结构分为子囊菌、担子菌、接合菌和壶菌等类群，而不产生有性孢子的真菌则被归为半知菌（Deuteromycetes）。随着分子生物学技术的发展，真菌分类系统发生了根本性变革。现代真菌分类主要基于多基因系统发育分析，尤其是核糖体DNA的ITS（内部转录间隔区）序列成为真菌鉴定的条形码。《真菌系统发育分类国际准则》已成为真菌分类的权威指南，定期更新以反映最新研究成果。主要真菌类群介绍（一）子囊菌门（Ascomycota）子囊菌门是真菌中最大的类群，包含约75%的已知真菌种类。特征是在有性生殖过程中形成子囊，子囊内含有子囊孢子。子囊菌的无性生殖通常通过分生孢子进行。子囊菌包括多种形态，从单细胞的酵母菌到复杂的大型子实体，如羊肚菌和虫草。重要类群包括：酵母菌（如酿酒酵母）、青霉属、曲霉属、镰刀菌属等。这些真菌在食品发酵、抗生素生产、作物病害等领域具有重要意义。担子菌门（Basidiomycota）担子菌门是一类高等真菌，特征是在有性生殖时形成担子，担子上产生担孢子。多数担子菌能形成大型可见的子实体，即常见的蘑菇、木耳等。担子菌门包括多个重要类群：伞菌纲（如香菇、平菇、毒蝇伞等）、层菌纲（如灵芝、多孔菌等）、锈菌纲和黑粉菌纲（重要植物病原菌）等。担子菌在食用菌生产、木材分解、植物共生和致病等方面具有重要作用。主要真菌类群介绍（二）接合菌门（Zygomycota）接合菌门是一类较为原始的真菌，特征是有性生殖时形成接合孢子，无性生殖通过孢子囊孢子进行。接合菌通常有发达的、不分隔的菌丝体。典型代表包括根霉属、毛霉属、蜘蛛网霉属等。接合菌在自然界中主要作为腐生菌分解有机物质，部分种类可引起食品腐败（如面包霉变）或机会性感染。接合菌在工业发酵、酶制剂生产等领域也有一定应用。壶菌门（Chytridiomycota）壶菌门是真菌中最为原始的类群，特征是孢子具有后生鞭毛，能在水中游动，故又称鞭毛菌。壶菌大多生活在水生或湿生环境中，形态结构相对简单。壶菌包括各种壶菌属、刺壶菌属等，主要作为腐生菌或寄生菌生存。其中最著名的是蛙壶菌，这种病原真菌导致全球两栖类大规模灭绝，对生物多样性造成严重威胁。壶菌在真菌进化研究中具有重要意义，被认为代表了从水生到陆生真菌的过渡。病毒分类系统巴尔的摩分类系统国际病毒分类委员会（ICTV）制定的官方病毒分类系统，采用等级分类法。最新版本将病毒分为界、门、纲、目、科、属、种等层级。分类标准包括病毒的核酸类型（DNA或RNA）、链数（单链或双链）、复制方式、形态结构、宿主范围等特征。主要病毒类群根据核酸类型和复制方式，病毒可分为七类：I类：双链DNA病毒；II类：单链DNA病毒；III类：双链RNA病毒；IV类：正链单链RNA病毒；V类：负链单链RNA病毒；VI类：反转录RNA病毒；VII类：反转录DNA病毒。每类包含多个科的病毒，如疱疹病毒科、小RNA病毒科、正黏病毒科等。最新进展随着宏病毒组学研究的发展，大量新病毒被发现，病毒分类系统不断更新。2020年，ICTV引入了15个新的病毒门，扩展了高级分类单位。此外，越来越多地采用基因组序列相似性作为分类标准，如病毒种的定义标准已从原来的血清学特性转向基因组特征。病毒主要类群介绍DNA病毒以DNA作为基因组的病毒，包括双链DNA病毒（如疱疹病毒、腺病毒、痘病毒等）和单链DNA病毒（如细小病毒）。DNA病毒通常在宿主细胞核内复制，部分种类能整合到宿主基因组中。一些DNA病毒与肿瘤发生相关，如人乳头瘤病毒和EB病毒。RNA病毒以RNA作为基因组的病毒，包括双链RNA病毒（如轮状病毒）、正链单链RNA病毒（如冠状病毒、痢疾病毒）和负链单链RNA病毒（如流感病毒、狂犬病毒）。RNA病毒通常在宿主细胞质中复制，由于缺乏校对机制，突变率较高，易产生变异株。反转录病毒具有特殊复制方式的RNA病毒，能通过反转录酶将自身RNA转录为DNA并整合到宿主基因组中。代表性病毒包括人类免疫缺陷病毒（HIV）、人T细胞白血病病毒等。这类病毒常导致慢性感染，与某些自身免疫性疾病和肿瘤相关。微生物分类学的新方法和新技术宏基因组学宏基因组学是直接从环境样品中提取所有微生物的总