CTAB法提取真菌基因组DNA.pdf
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CTAB 法提取真菌(霉菌、酵母)基因组 DNA--试剂配制方法及操作步骤
一、试剂配制
(一)2%CTABB 中液:
1、 各试剂终浓度:
CTAB 粉末——20g/L
即 10X TE
( Tris-HCl PH
8.0——100 mmol/L
EDTA PH
8.0——20 mmol/L }
NaC ——
1.4mol/L
2、 配制方法:
(1) 配制 1L: 20gCTAB+100mlTris-HCt 液(1m/L) +40mlEDTA 母液(
)
0.5m/L +
81.816gNaC 定容至 1L。
( )
(2 ) 配制 100ml: 2gCTAB+10mlTris-HC©液 1m/L +4mlEDTA 母液(
)
0.5m/L +
8.1816gNaC 定容至 100m 。
(3 ) 配置 1X TE100ml10ml Tris-HC 母液(1m/L) + 4ml EDT 如液(
0.5m/L )
(二) 筑基乙醇
分装1ml 于离心管中,2%CTAE^冲液与筑基乙醇以50:1 体积混合。
(三) Tris-苯酚、氯仿、异戊醇
1、 各试剂浓度:
苯酚/氯仿/异戊醇(25: 24: 1 )
2、 配制方法:
(
Tris-HCl 平衡苯酚与等体积的氯仿/异戊醇 24: 1)混合均匀,即,移入棕色玻
璃瓶中4C 保存。
(四) NaAc 和 Nacl
1、 浓度:3mol/L
2、 配制方法:
(1) 3MNaAc10ml:
称取
2.46gNaAq pH
4.0,用 H2O 定容到10ml; (称量
40.8gNaOAc.H2C®于烧杯中,加入冰醋酸调节 pH 到
5.2,定容到 100ml);
(2 ) 5M NaCl 100ml:
称取
29.22g NaCl 用 H2 。定容到 100ml 称取
292.2gNaCl 置于1L 烧杯中,加入约800 ml 的去离子水后搅拌溶解加去离子水
将溶液定容到1L 后,适量分成小份高温高压灭菌后,4C 保存。
二、试验准备
(一)
1、周压
1.5ml 无核酸酶离心管Xn 个样品、2ml、5ml 离心管;
2、高压超纯水500ml (去离子水)用于试剂配制;
3、枪头 10 小 200 小 1000U;
(二)
1、筑基乙醇10 U X 企样品,分装于2ml 管;
2、Tris-苯酚500 X 命样品,分装于5ml 管;
3、氯仿480 M X 企样品,分装于5ml 管;
4、异戊醇20 U X 企样品,分装于5ml 管;
5、70%乙醇
1.2ml X 个样品,分装于5ml 管;
6、水浴锅65C 预热、37C 预热;
7、NaAc150U X 企样品,分装于5ml 管;
8、-20 C 预冷无水乙醇
,
1.1ml X 个样(或异丙醇) 800U X 企样品、氯仿异戊醇(24:1 ) 500X 命 样
品;
(
9、RaseA 酶 10mg/ml)解冻;
二、试验步骤
1、2%CTA 累解液500 U X 企样品,放于65C 水浴锅中预热;
2、真菌悬液离心得到大约100mg 真菌组织于
2.0 mL 离心管;
3、10 M X 命样品筑基乙醇加到预热的 2%CTAE®解液中;
4、每个样品中加510 U CTAB 和筑基乙醇混合液,100mg 玻璃珠,旋涡震荡研
磨裂解30min 或以上(裂解一定要彻底);
5、放入65C 水浴锅中,保温30~60min,期间轻摇数次(一般20min 左右一次,
刚投入水浴时可以稍快速的晃动,之后的晃动一定要轻柔)。
6、加入5--10^1 (试剂盒
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