微生物进化系统发育分类.ppt

第一节进化的测量指征 高等动植物判断亲缘关系:形态结构、生理生 化、行为习性等表型特征,少量的化石资料 微生物:形体微小、结构简单、缺少有性繁殖 过程,依靠表型特征无法测量其系统发育 进化指征的选择: 微生物的系统发育,主要是分析和比较生物大分子 的结构特征,特别是蛋白质、RNA和DNA这些反映生 物基因组特征的分子序列,作为判断各类微生物乃 至所有生物进化关系的主要指征 蛋白质、RNA和DNA序列进化变化的显著特点是进化 速率相对恒定 合适的指征大分子 1、必须普遍存在于所研究的各个生物类群中 2、在各种生物中功能同源的大分子 3、为了鉴定大分子序列的同源位置或同源区, 要求所选择的分子序列必须能严格线性排列, 以便进行进一步的分析比较 4、根据所比较的各类生物之间的进化距离来 选择适当的分子序列(选择进化速率低的分子 序列 8题 rRNA作为进化的分子指征依据 、RM参予生物蛋自质的合成过程,其功能是任何生物都必不 可少的,而且在生物进化的漫长历程中,其功能保持不变 2、在16SRNA分子中(系谱分析的分子尺,古化 既含有高 度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区 因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究 3、16 SrRNA分子量大小适中,便于序列分析.(5S\16S\23S,120 4、rRN普遍存在于真核生物和原核生物中,且占总RNA的90%, 便于提取(伍斯) R基因 真核生物rN基因结构 P2 165 rRNA 235 TRNA 55FN前体间陽区 455rRk前体 23S rRNA rRNA序列测定和分析方法 1、寡核苷酸编目分析法-30%序列, 发现古生菌 ↓ (1)16 SSrRNA提取—1核酸酶水解一 同位素标记一电泳分离、放射自 revert 显影技术、电泳图谱,确定寡核」 苷酸分子序列 相似性系数法和序列印记法比较亲 缘关系 相似性系数法通过计算相似性飞飞 系数S值来确定微生物之间的关 序列印记法:通过序列比较后,mm SeNE 若发现某些序列仅为某种(群)微c-「 写, 生物所特有,这些序列即可作为hm 该种(群)微生物的印记序列 序列印记通常出现在某一特定系统发育群的全部 成员或绝大多数成员。 20世纪70年代末,生命分为三界的理论,就是采 用寡核苷酸编目分析法对大量微生物分析比较后 提出来的 Mixture of macromolecules Electrophoresis Direction of 电泳的原理