微生物的进化系统发育分类.pptx
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第一节 进化的测量指征;合适的指征大分子;1、rRNA参予生物蛋白质的合成过程,其功能是任何生物都必不可少的,而且在生物进化的漫长历程中,其功能保持不变
2、在16SrRNA分子中(系谱分析的分子尺,古化石),既含有高度保守的序列区域,又有中度保守和高度变化的序列区域,因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究
3、16SrRNA分子量大小适中,便于序列分析.(5S\16S\23S,120个核苷酸\1540\2900)
4、rRNA普遍存在于真核生物和原核生物中,且占总RNA的90%,便于提取(伍斯)。;rRNA序列测定和分析方法;电泳的原理;古生菌、细菌和真核生物的16S(18S)RNA的印记序列;;系统发育树 ;全生命系统树(Olsen和Woese 1993) ;三界生物的主要特征;;第二节 细菌分类;七级分类单元;分类单元及其等级;双命名法;种名几点说明;种的分类地位举例;亚种以下的各类型;;
地球上生存的菌物约有150万种,目前已记载的只有7-9万种,每年以发现1500个新种的速度递增。
Ainsworth系统是常用的菌物分类系统:
《安·贝氏菌物词典》之1995年已第八版,而且每版均有变化。;伯杰氏系统细菌学手册第二版 ;第三节 微生物分类鉴定的特征和技术;一、微生物鉴定的经典方法;;1、常用于分类和鉴定的形态学特征;2、常用于微生物分类鉴定的生理生化特征;3、血清学试验与噬菌体分型;4、氨基酸顺序和蛋白质分析;5、核酸的碱基组成和分子杂交;DNA-DNA;染色体的原位杂交;;遗传重组;第四节 微生物的快速鉴定和自动化分析技术;“API”细菌数值鉴定系统;API 10 S???? 最常见革兰氏阴性杆菌API NH?????? 奈瑟民菌、嗜血杆菌属API 20 STREP 链球菌及有关菌API CAMPY??? 弯曲杆菌API CORYNE?? 棒状菌群MI LISTERIA? 李斯特菌属API 20E????? 革兰氏阴性杆菌(肠杆菌科)API 2ONE????? 菲肠道革兰民阴性杆菌API 2OA?????? 厌氧菌API 20C AUX?? 酵由菌API STAPH??? 葡萄球菌和微琼菌……;API20E反应判定表;API 20E鉴定卡示意图 ;操 作 简 便;Enterotube系统 ;Enterotube系统的接种过程 ;“Biolog”全自动和手动系统;细菌生理生化全自动鉴定仪;大肠菌测试卡;6个鉴定系统的优、缺点比较;二、快速、自动化微生物检测仪器和设备;几种微生物快速测量仪;rRNA序列测定和分析方法;种名几点说明;亚种以下的各类型;;伯杰氏系统细菌学手册第二版 ;伯杰氏系统细菌学手册第二版 ;大肠菌测试卡;6个鉴定系统的优、缺点比较
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