南瓜属EST-SSR标记的开发及在杂种纯度鉴定中的应用.pdf

- C T ● linRICULTURAE 01 华北农学报·2011，26(6)：97．1 BOREALI-|IHIG| 南瓜属EST-SSR标记的开发及 在杂种纯度鉴定中的应用 张国裕，张 帆，姜立纲，翟伟卜，李海真 (国家蔬菜工程技术研究中心，北京100097) 摘要：为利用SSR标记进行快速、准确的南瓜杂交种纯度分析，进行了南瓜EST—SSR标记的开发。从NCBI数据 库下载1 将215个SSR位点设计成EST—SSR引物后，随机合成了其中的43对引物。利用4份遗传背景差异较大的南瓜自交系 对合成的43对引物进行扩增效果评价，其中28对引物有稳定清晰的扩增产物，占合成引物的65．12％。利用这些有 效扩增引物对南瓜属作物商品杂交种进行纯度检测，共获得13个杂交组合的特异性检测引物，F，杂交种的纯度在 79．2％～100．0％，与田间检测结果相符。结果表明，利用南瓜EST序列开发SSR引物具有简单快速、成本低和适用 性好的特点。 关键词：南瓜；EST—SSR；标记开发；杂种纯度 中图分类号：$642．1文献标识码：A 文章编号：1000—7091(2011)06—0097—05 EST—SSRMarkers fromCucurbitaand Development TheirUsein ofF Seed PurityTesting1 Hybrid ZHANG Hai—zhen Fan，JIANG Wei—bo，LI Guo—yu，ZHANG Li—gang，ZHAI (National ResearchCenterfor 100097，China) Engineering Vegetables，Beijing a of be source can used Abstract：ExpressedSequenceTags(ESTs)aresimplesequencerepeats(SSRs)that to molecularmarkersfor studies．Theofthe is to EST—SSRmarkers develop genetic object presentstudy develop Cucurbitaand these in from uses markers of seed．The of1457ESTsfor quicklypuritytestingFlhybrid availability in documented a to EST-SSR 215 cucurbita，which GenBank，provided markers，and uniqueopportunitydevelop SSRswereidentifiedthesenon-redundant