小麦EST-SSR标记的开发及其耐盐基因的分子标记的开题报告.docx

小麦EST-SSR标记的开发及其耐盐基因的分子标记的开题报告 开题报告 题目：小麦EST-SSR标记的开发及其耐盐基因的分子标记 学生姓名：xxx 指导教师：xxx 一、研究背景 随着人口的不断增加和自然环境的恶化，土壤盐碱化问题日益突出，这导致了大量农田的退化和荒芜，严重影响了农业的发展。而小麦作为世界上最重要的粮食作物之一，其异源四倍体的基因组比较复杂，对盐碱逆境的适应性也相对较强，因此成为了研究耐盐机制的一个重要模式植物。 目前，小麦的分子标记技术已经取得了长足的进展，比如EST-SSR标记在小麦遗传学和基因工程研究中的应用越来越广泛，成为了当前研究的重点之一。但是目前关于小麦EST-SSR标记的开发以及其在耐盐基因的分子标记等方面，尤其在我国相关研究比较缺乏，因此我们有必要对其进行更深入的探究。 二、研究目的 本研究旨在通过cDNA文库筛选，开发一批小麦EST-SSR标记，并对其进行鉴定和验证，以期为小麦品种鉴定、种质资源保护、耐盐基因的分子标记等方面提供一定的理论和实践基础。 三、研究内容 1. 构建小麦cDNA文库，并进行EST序列的获取和分析。 2. 设计EST-SSR引物并进行扩增和鉴定，优化PCR条件和电泳条件。 3. 对所得EST-SSR标记进行多态性分析和遗传连锁图构建。 4. 选取耐盐基因候选基因，设计特异性引物对其进行PCR扩增和验证，从而确定耐盐基因与所开发的EST-SSR标记之间的遗传联系。 四、研究方法 1. 购买小麦的幼苗并进行植物RNA的提取和纯化。 2. 利用SMARTer? cDNA Synthesis Kit构建小麦cDNA文库，并对文库进行质检和扩增。 3. 从所得cDNA文库中筛选EST序列，并进行BLAST比对和分析。 4. 根据所得EST序列中含有的SSR位点，设计EST-SSR引物。 5. 对所选取的小麦品种进行EST-SSR标记的PCR扩增和电泳鉴定，选择多态性较好的标记进行下一步的工作。 6. 利用软件对所得位点进行多态性和遗传连锁图分析。 7. 选取耐盐基因候选基因，设计特异性引物，对其进行PCR扩增和验证，进行耐盐基因与所开发的EST-SSR标记之间的遗传联系分析。 五、预期结果 1. 成功构建小麦cDNA文库并开发出一系列EST-SSR标记。 2. 对所得标记进行鉴定和多态性分析，并进行遗传连锁图的构建。 3. 确定耐盐基因与所开发的EST-SSR标记之间的遗传联系。 六、研究意义 小麦是我国重要的粮食作物之一，耐盐基因的研究具有重要的理论和应用价值。本研究不仅可以为小麦品种鉴定、种质资源保护和耐盐基因的分子标记等方面提供理论和实践基础，同时也可以促进小麦耐盐机制的探究和利用，为提高小麦产量和品质做出贡献。