SSR分子标记技术在杂交水稻种子纯度鉴定中的应用.pdf

( ) ( ) 杂交水稻 HYBRID RICE ,2006 ,21 4 :11 - 14 ·11 · SSR 分子标记技术在杂交水稻种子纯度鉴定中的应用 李召华 ,朱克永 ,陈祖武 ,詹庆才 (湖南省水稻研究所 生物技术研究室 ,湖南 长沙 　410125) 摘　要 :SSR 标记由于具有数量丰富、多态性高、遗传上呈共显性、实验操作简单、结果稳定可靠、引物序列易交流等优点 , 已成为杂 交水稻种子纯度鉴定的一种理想分子标记。概述了 SSR 分子标记技术应用于杂交水稻种子纯度鉴定的原理、技术要点及其研究 进展 ,并就该技术产业化应重点考虑的问题进行了讨论。 关键词 :杂交水稻 ;种子 ;纯度鉴定 ;SSR 分子标记 ( ) 中图分类号:S511. 01 ;Q503 　　文献标识码 :A 　　文章编号 :1005 - 3956 2006 04 - 0011 - 04 　　种子纯度是杂交水稻种子质量的核心指标 ,是 phism) ,是指基因组中由 1～6 个核苷酸组成的基本 种子质量分级的主要标准 ,是企业购销种子的关键 单位重复多次构成的一段 DNA ,广泛分布于基因组 依据 ,历来受到种子管理部门、种子企业和农民的密 的不同位置 ,长度一般在 200 bp 以下,相同座位上 切关注。目前应用于杂交水稻种子纯度鉴定的方法 的重复序列由于重复次数不同而产生了等位基因的 主要有 :种子籽粒形态鉴定、酯酶同工酶鉴定、田间 多态性。每个微卫星 DNA 侧翼的序列一般是同一 小区种植鉴定、DNA 分子标记鉴定。不同杂交水稻 物种或近缘品种中相对保守的单拷贝序列 ,通过这 品种种子籽粒形态差异有限 ,而酯酶同工酶法是鉴 段序列可以设计一段互补寡聚核苷酸引物 ,对 SSR ( 别不同品种基因表达产物蛋白质之间的差异 , 多态 进行 PCR 扩增 结合区为物种保守区 ,扩增区为基 ) 性不够丰富 ,且有组织和器官特异性 ,使取材受到严 因组中的重复区 ,SSR 扩增产物通常采用高浓度的 格限制 ,从而限制了其应用[1 ] 。田间小区种植鉴定 琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 ,显示出不 因周期过长 ,植株性状表达易受环境影响 ,也不能完 同品种间重复次数的差异[3～4 ] 。 全满足生产经营的需要。而 DNA 分子标记反映了 SSR 标记由于具有数量丰富、多态性高、遗传上 DNA 水平上生物个体间的遗传差异 , 具有数量丰 呈共显性、实验操作简单、结果稳定可靠、引物序列 富、多态性高、不受环境影响、检测快速等优点而逐 易交流等优点 , 是一种理想的分子标记技术。Wu