生物信息学 实验 核酸序列分析.doc

核酸序列分析 【实验目的】 掌握核酸序列检索的基本步骤；熟悉基于核酸序列分析的真核基因结构分析（内含子/外显子分析）；掌握使用软件进行核酸序列的基本分析实验内容1、使用Entrez信息查询系统检索人瘦素 (leptin) 的mRNA、基因组DNA、外显子等核酸序列，连接提取该序列内容，阅读序列格式的解释，理解其含义； 使用对上述核酸序列进行分析’ 使用软件对人瘦素 (leptin) 的mRNA序列进行可读框架分析； 使用NCBI查询系统进行人瘦素 (leptin) 的基因组序列分析实验1、调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址/Entrez ； 2在Search后的选择栏中选择nucleotide； 3在输入栏输入homo sapiens leptin; 4点击go后显示5、查找人leptin，点击序列接受号后显示序列详细信息； 6将序列转为FASTA格式保存 7将上述核酸序列输入DNAClub软件进行序列基本分析；8、根据基因定位信息查找人瘦素的基因组DNA (Contig) 的序列接受号及序列识别号，点击序列接受号显示序列详细信息； 人瘦素 (leptin) 的基因组序列； 【作业】 1、归纳对人瘦素 (leptin) 的序列人leptin mRNA ORIGIN 1 gtaggaatcg cagcgccagc ggttgcaagg taaggccccg gcgcgctcct tcctccttct 61 ctgctggtct ttcttggcag gccacagggc cccacacaac tctggatccc ggggaaactg 121 agtcaggagg gatgcagggc ggatggctta gttctggact atgatagctt tgtaccgagt ...... 10681 ctccttgcag tgtgtggttc cttctgtttt caggcccaag aagcccatcc tgggaaggaa 10741 aatgcattgg ggaaccctgt gcggattctt gtggctttgg ccctatcttt tctatgtcca 10801 agctgtgccc atccaaaaag tccaagatga caccaaaacc ctcatcaaga caattgtcac 10861 caggatcaat gacatttcac acacggtaag gagagtatgc ggggacaaag tagaactgca 10921 gccagcccag cactggctcc tagtggcact ggacccagat agtccaagaa acatttattg ...... 13021 aggcagccca gagaatgacc ctccatgccc acggggaagg cagagggctc tgagagcgat 13081 tcctcccaca tgctgagcac ttgttctccc tcttcctcct gcatagcagt cagtctcctc 13141 caaacagaaa gtcaccggtt tggacttcat tcctgggctc caccccatcc tgaccttatc 13201 caagatggac cagacactgg cagtctacca acagatcctc accagtatgc cttccagaaa 13261 cgtgatccaa atatccaacg acctggagaa cctccgggat cttcttcacg tgctggcctt 13321 ctctaagagc tgccacttgc cctgggccag tggcctggag accttggaca gcctgggggg 13381 tgtcctggaa gcttcaggct actccacaga ggtggtggcc ctgagcaggc tgcaggggtc 13441 tctgcaggac atgctgtggc agctggacct cagccctggg tgctgaggcc ttgaaggtca 13501 ctcttcctgc aaggactacg ttaagggaag gaactctggc ttccaggtat ctccaggatt ...... 16081 cactagatgg cgagcatcct ggccaacatg gtgaaacccc gtctctacta aaaacacaaa 16141 agttagct