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应用酵母双杂交技术筛选直藻MBP相互作用蛋白的中期报告
本次实验旨在利用酵母双杂交技术筛选直藻(Thalassiosira pseudonana)中MBP(maltose-binding protein)相互作用蛋白。
首先,从直藻中提取总RNA,利用逆转录酶将其转录为cDNA。将得到的cDNA插入到双杂交载体pGBKT7-MBP中,构建出pGBKT7-MBP-cDNA文库。然后将构建好的文库与pGADT7-MBP进行转化,将构建出的双杂交酵母菌株进行筛选。
通过酵母菌落PCR对转化后的酵母菌株进行检测,结果显示插入率约为80%。进一步筛选正交互作的酵母菌株,利用X-α-gal和Aureobasidin A两种筛选方法进行筛选,结果表明仅有极少数菌株呈现两种筛选方法均为阳性。
随后,对阳性菌株进行扩增,提取质粒DNA进行测序及比对分析,初步鉴定出可能与MBP相互作用的蛋白。要进一步验证这些蛋白的相互作用,可以进行蛋白质相互作用实验,如GST pull-down实验、Co-IP实验等,以及进一步鉴定对MBP功能的调控作用。
综上所述,我们通过酵母双杂交技术筛选出可能与直藻MBP相互作用的蛋白,为进一步研究直藻MBP的功能及作用机制提供了一定的基础。
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