大蒜全基因组中ABCB基因的鉴定与表达分析.docx

大蒜全基因组中ABCB基因的鉴定与表达分析

目录

大蒜全基因组中ABCB基因的鉴定与表达分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．3

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

大蒜基因组研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1大蒜基因组结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.2基因表达调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.3ABCB基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

ABCB基因的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.1基因序列检索与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.2基因结构预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

3.3基因同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

ABCB基因的表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

4.1实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

4.2基因表达水平测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

4.3基因表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

ABCB基因功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

5.1功能预测与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

5.2生物学功能实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

5.3功能验证结果讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

ABCB基因与大蒜生长发育的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

6.1ABCB基因在不同发育阶段的表达模式．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

6.2ABCB基因与大蒜抗逆性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

6.3ABCB基因与大蒜产量关系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

大蒜全基因组中ABCB基因的鉴定与表达分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．30

一、内容概括．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

1.3研究内容与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

二、大蒜ABCB基因概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.1ABCB基因简介．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.2ABCB基因家族成员．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.3ABCB基因在植物中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

三、大蒜ABCB基因的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

3.1基因组数据获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

3.2基因预测与注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

3.3基因序列比对与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．