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甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析.docx

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甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析

目录

甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析(1)...........3

一、内容简述...............................................3

1.1甜瓜的重要性...........................................3

1.2SULTR基因家族的介绍及其研究价值........................4

1.3研究目的与问题提出.....................................5

二、研究方法...............................................6

2.1甜瓜基因组数据的获取与处理.............................7

2.2SULTR基因家族的鉴定与筛选..............................8

2.3生物信息学分析方法.....................................9

三、甜瓜CmSULTR基因家族的鉴定.............................10

3.1基因家族的确定与特点分析..............................11

3.2家族成员的结构与功能域分析............................12

3.3系统进化树的构建及分类................................13

四、甜瓜CmSULTR基因家族的表达分析.........................14

4.1表达模式的时空差异分析................................15

4.2不同组织器官中的表达水平分析..........................16

4.3响应生物胁迫与非生物胁迫的表达变化....................17

五、讨论..................................................18

5.1甜瓜CmSULTR基因家族的表达模式与功能关系...............19

5.2与其他物种SULTR基因家族的对比与分析...................21

5.3本研究的优点与局限性..................................22

六、结论..................................................23

6.1研究成果总结..........................................24

6.2对未来研究的建议与展望................................25

甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析(2)..........26

一、内容描述..............................................26

研究背景及意义.........................................27

研究目的和任务.........................................27

二、甜瓜基因组概述........................................29

甜瓜基因组特点.........................................29

基因组测序及组装情况...................................31

三、CmSULTR基因家族的鉴定.................................31

基因序列的获取与分析...................................32

基因家族的鉴定与命名规则...............................33

基因家族成员的分类和特点...............................34

四、CmSULTR基因家族的全基因组分布.........................35

基因家族在染色体上的分布...............................36

基因家族的拷贝数变异...................................36

五、CmSULTR基因家族的表达分析.............................38

表达模式的获取与分析方法......................

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