甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析.docx
甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析
目录
甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析(1)...........3
一、内容简述...............................................3
1.1甜瓜的重要性...........................................3
1.2SULTR基因家族的介绍及其研究价值........................4
1.3研究目的与问题提出.....................................5
二、研究方法...............................................6
2.1甜瓜基因组数据的获取与处理.............................7
2.2SULTR基因家族的鉴定与筛选..............................8
2.3生物信息学分析方法.....................................9
三、甜瓜CmSULTR基因家族的鉴定.............................10
3.1基因家族的确定与特点分析..............................11
3.2家族成员的结构与功能域分析............................12
3.3系统进化树的构建及分类................................13
四、甜瓜CmSULTR基因家族的表达分析.........................14
4.1表达模式的时空差异分析................................15
4.2不同组织器官中的表达水平分析..........................16
4.3响应生物胁迫与非生物胁迫的表达变化....................17
五、讨论..................................................18
5.1甜瓜CmSULTR基因家族的表达模式与功能关系...............19
5.2与其他物种SULTR基因家族的对比与分析...................21
5.3本研究的优点与局限性..................................22
六、结论..................................................23
6.1研究成果总结..........................................24
6.2对未来研究的建议与展望................................25
甜瓜CmSULTR基因家族的全基因组鉴定与表达分析(2)..........26
一、内容描述..............................................26
研究背景及意义.........................................27
研究目的和任务.........................................27
二、甜瓜基因组概述........................................29
甜瓜基因组特点.........................................29
基因组测序及组装情况...................................31
三、CmSULTR基因家族的鉴定.................................31
基因序列的获取与分析...................................32
基因家族的鉴定与命名规则...............................33
基因家族成员的分类和特点...............................34
四、CmSULTR基因家族的全基因组分布.........................35
基因家族在染色体上的分布...............................36
基因家族的拷贝数变异...................................36
五、CmSULTR基因家族的表达分析.............................38
表达模式的获取与分析方法......................