AP2ERF基因家族成员鉴定及功能解析.docx

AP2ERF基因家族成员鉴定及功能解析

目录

一、内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.3研究内容与目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.4研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

二、AP2ERF基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.1AP2ERF基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.1.1AP2ERF基因家族定义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.1.2AP2ERF基因家族分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2蛋白质数据库检索与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.3AP2ERF基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.3.1序列比对分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

2.3.2蛋白结构域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.4AP2ERF基因家族系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

2.5AP2ERF基因家族成员在物种中的分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

三、AP2ERF基因家族成员结构特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.1AP2ERF基因家族成员氨基酸序列分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.1.1蛋白长度分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

3.1.2蛋白等电点分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

3.1.3蛋白疏水性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

3.2AP2ERF基因家族成员结构域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

3.3AP2ERF基因家族成员保守基序分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

四、AP2ERF基因家族成员表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

4.1数据库选择与数据提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

4.2AP2ERF基因家族成员在不同组织中的表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

4.3AP2ERF基因家族成员在不同物种中的表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

4.4AP2ERF基因家族成员在不同发育阶段的表达．．．．．．．．．．．．．．．．43

4.5AP2ERF基因家族成员在不同环境条件下的表达．．．．．．．．．．．．．．44

五、AP2ERF基因家族成员功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

5.1蛋白质亚细胞定位预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

5.2蛋白质相互作用预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

5.3蛋白质功能域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

5.4AP2ERF基因家族成员可能的功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

六、AP2ERF基因家族成员功能实验验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

6.1实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

6.1.1载体构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

6.1.2细胞培养与转染．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

6.1.3基因敲低与过表达．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57

6.1.4实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．