马铃薯GH3基因家族成员的鉴定与表达分析.docx

马铃薯GH3基因家族成员的鉴定与表达分析

目录

马铃薯GH3基因家族成员的鉴定与表达分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．．4

内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1马铃薯材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.2基因克隆与测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.3生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.4实时荧光定量PCR分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

马铃薯GH3基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

3.1基因序列同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

3.2基因结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.3基因表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

马铃薯GH3基因家族成员表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

4.1基因表达水平分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

4.2基因表达模式比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

4.3基因表达与环境因素的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

马铃薯GH3基因家族成员功能分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

5.1基因功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

5.2基因功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

5.3基因功能与马铃薯抗逆性的关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

马铃薯GH3基因家族成员的鉴定与表达分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．．19

一、内容描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

研究背景及意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

（1）马铃薯的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

（2）GH3基因家族的研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

（3）研究的必要性和预期目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

研究方法与内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

二、马铃薯GH3基因家族成员的鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

生物信息学鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

（1）基因序列获取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

（2）基因序列分析软件及数据库．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

（3）GH3基因家族的鉴定与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

实验鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

（1）实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

（2）实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

（3）鉴定结果分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

三、马铃薯GH3基因家族成员的表达分析