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DB22_T2909-2018_H5N8亚型禽流感病毒HA和NA基因荧光RT-PCR检测方法_吉林省.docx

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ICS11.220

DB22

B41

吉林省地方标准

DB22/T2909—2018

H5N8亚型禽流感病毒HA和NA基因荧光

RT-PCR检测方法

Methodofthereal-timePCRforthedetectionofHAandNAgenesofAvian

influenzasubtypeH5N8

吉林省市场监督管理厅

发布

DB22/T2909—2018

前言

本标准按照GB/T1.1-2009和GB/T20001.4-2015给出的规则起草。

本标准由长春海关(原吉林出入境检验检疫局)提出并归口。

本标准起草单位:吉林出入境检验检疫局检验检疫技术中心。

本标准主要起草人:王伟利、姚贵哲、孟庆峰、刘金华、王岸英、王准、肖芳、马玲。

I

DB22/T2909—2018

H5N8亚型禽流感病毒HA和NA基因荧光RT-PCR检测方法

1范围

本标准规定了H5N8亚型禽流感病毒HA和NA基因荧光RT-PCR检测方法的原理、材料与试剂、仪器设备、

样品、试验步骤和试验数据处理技术要求。

本标准适用于H5N8亚型禽流感病毒HA和NA基因检测。

2规范性引用文件

下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文

件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。

GB/T19438.1禽流感病毒通用荧光RT-PCR检测方法

3

缩略语

下列缩略语适用于本文件

NA:神经氨酸酶(neuraminidase)

根据H5N8亚型禽流感病毒HA基因和NA基因序列设计引物和探针,探针结合部位在扩增片段内部。HA

基因和NA基因探针分别在5’端标记VIC和FAM荧光素作为报告荧光基团,3’端分别标记MGB和BHQ1作为淬

灭荧光基团。反应进入退火阶段时,引物和探针同时与目的基因片段结合,此时探针上荧光基团发出的

荧光信号被淬灭基团所吸收,仪器检测不到荧光信号;而反应进行到延伸阶段时,Taq酶发挥5’→3’的

外切核酸酶功能,将探针降解。探针上的荧光基团游离出来,所发出的荧光不再为淬灭基团所吸收而被

检测仪所接收。随着PCR反应的循环往复,PCR产物呈指数形式增长,荧光信号也相应增长。据此荧光PCR

仪可实现对HA基因和NA基因的同步实时检测。

5.1.1离心管(1.5mL、0.2mL)。

1

DB22/T2909—2018

5.1.2荧光PCR反应管。

5.2试剂

5.2.1裂解液

5.2.2阴性对照:可采用健康的动物组织材料或经灭活的不含禽流感病毒的鸡胚尿囊液。

5.2.3阳性对照:非感染性体外转录RNA,-20℃保存备用。

5.2.4氯仿(分析纯)。

5.2.5异丙醇(分析纯)。

5.2.675%乙醇。

5.2.7

DEPC水:0.1%DEPC处理后的去离子水。

5.2.82×RT-PCRBuffer

5.2.9RTEnzymeMix

5.2.10Taq酶

5.2.11引物与探针:

HA基因:

引物F1:5’–CTTGCGACTGGGCTCAGAAAT–3’;

引物R1:5’–TTTGGGTGGATTCTTTGTCTGC–3’;

探针P1:VIC-CATTCCTTGCCATCC-MGB;

NA基因:

引物F2:5’-CTCCAAGAGGGGAAGATGCT-3’;

引物R2:5’-CTGACCTGGAGGTTCGACTA–3’,

探针P2:FAM-CGCCCCACCCACACATCAGTTCCCTGT-BHQ1,

8.1.1.2每管加入600μL裂解液,分别加入被检样本、阴性对照(5.2.2)、阳性对照(5.2.3)各

200μL,再加入200μL氯仿(5.2.4),旋涡振荡器(6.1)充分振荡混匀,置高速冷冻离心机(6.2)

4℃12000r/min离心15min。

2

DB22/T2909—2018

8.1.1.3取灭菌的1.5mL离心管(5.1.1),加入-20℃预冷400μL异丙醇(5.2.5),吸取8.1.2

各管中的上清液转移至相应的离心管(5.1.1)中,避免吸出中间层,颠倒混匀,置高速冷冻离心机(6.2)

4℃12000r/min离心15min,弃上清,倒置于吸水纸上,沾干液体;加入600μL75%预冷乙醇(5.2.6),

颠倒洗涤。

8.1.1.4置高速冷冻离心机(6.2)4℃12000r/min离心10min,弃上清。

8.1.1.5将8.

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