生物统计学(版)杜荣骞课后习题答案十实验设计.doc
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第十二章 实验设计
12.1 一项关于在干旱地区生长的一种杨树（Populus euphratica），在土壤中的水分逐渐丧失后，其基因表达、蛋白谱、生态生理学及生长性能等方面产生可逆性改变的研究。作者在本实验的5个时间点上（H5为对照），用qPCR方法度量了该杨树叶子中的三个基因的转录丰度比[83]，表中给出的为阵列数据：
GenBank ID 基 因 H1 H2 H3 H4 H5 AJ 780 423 半胱氨酸蛋白酶 0.7 1.0 2.3 13.1 1.9 AJ 780 698 环核苷酸和钙调节的离子通道 1.5 1.2 3.0 4.3 1.5 AJ 777 362 核糖体蛋白 1.1 1.1 1.0 0.9 1.2 借用上述数据，以三个基因作为三个区组，计算在5个时间点上转录丰度比差异是否显著？
答：随机化完全区组实验设计方差分析的程序，类似于两因素交叉分组实验设计。以下是本题的程序和结果：
options linesize=76 nodate;
data poplar;
do block=1 to 3;
do time=1 to 5;
input trans @@;
output;
end;
end;
cards;
0.7 1.0 2.3 13.1 1.9
1.5 1.2 3.0 4.3 1.5
1.1 1.1 1.0 0.9 1.2
;
proc anova;
class block time;
model trans=block time;
run;
The SAS System
The ANOVA Procedure
Class Level Information
Class Levels Values
block 3 1 2 3
time 5 1 2 3 4 5
Number of observations 15
The SAS System
The ANOVA Procedure
Dependent Variable: trans
Sum of
Source DF Squares Mean Square F Value Pr F
Model 6 72.5560000 12.0926667 1.53 0.2809
Error 8 63.1013333 7.8876667
Corrected Total 14 135.6573333
R-Square Coeff Var Root MSE trans Mean
0.534848 117.6745 2.808499 2.386667
Source DF Anova SS Mean Square F Value Pr F
block 2 18 9 1.19 0.3519
time 4 53 13 1.70 0.2416 从上表中的结果可以看出，如果按随机化完全区组设计进行分析，不同时间点之间的差异不显著。
归纳成一般格式的方差分析表如下：
变差来源 平方和 自由度 均方 F P 区 组 18.825 333 33 2 9.412 666 67 1.19 0.351 9 时间点 53.730 666 67
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