蛋白质杂交题稿.ppt
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Western blot 实验技术;定义:;Western Blot基本原理;Western Blot一般流程;;;通过有机溶剂或水溶法制备总蛋白
1.水溶液提取法
针对水、稀盐、稀酸或碱溶液中的蛋白质。稀盐和缓冲系统的水溶液对蛋白质稳定性好、溶解度大、是提取蛋白质最常用的溶剂 。盐析沉淀出的蛋白质一般保持着天然构象。常用的中性盐是硫酸铵。
细胞裂解液: 50 mmol/L Tris-HCl, 150 mmol/L Nacl ,5 mmol/L EDTA, 1%NP40 , 0.05% PMSF , 2μg/mL Aprotinin, 0.5μg/mL Leupeptin , pH8.0
;2.低温有机溶剂提取法
蛋白质处在一定量的有机溶剂中,分子间极性基团的静电引力增强,水化作用降低,蛋白质聚集而沉淀。对于分子中非极性侧链较多的蛋白质可用有机溶剂提取,包括乙醇、丙酮和丁醇等。该法沉淀蛋白质的选择性较高,不需脱盐。
3.水溶性多聚物沉淀法
聚乙二醇(PEG)、葡聚糖(DEX)等溶于水中,蛋白质的极性基团与多聚物分子中的氧或氢氧根结合,形成二者的复合体,从溶液中沉淀析出。改变多聚物的浓度可分段沉淀出不同的蛋白质。
4. 通过层析或电洗脱法、色谱等制备目的蛋白
;重组蛋白的特点:
目的蛋白质的量较多,至少点总蛋白量的1%,常为5%-9%,使纯化易于进行。
可利用融合蛋白质的特性进行纯化。利用标示物(tag)的特性,用亲合层析柱,可快速分离纯化融合蛋白质,最后切除tag即可。很多表达载体已带有tag的DNA序列。;重组蛋白的特点:
包含体的形成。主要出现在大肠杆菌等原核生物中,溶解度很小的蛋白都进入包含体中,包含体中的蛋白质主要是外来性的重组蛋白。离心的方法先收集包含体,再从中分离蛋白。
分泌蛋白质的生成。目的蛋白前加入信号肽序列,可使真核细胞内表达的蛋白分泌到培养基中,因其中的蛋白质种类较少而使目的蛋白的分离纯化得以简化。大肠杆菌等有细胞壁的细胞可分泌至周质中,收集细胞后,改变渗透压,同时加入少量溶菌酶破坏细胞壁,提取周质后,纯化目的蛋白。;蛋白样品的定量;蛋白样品的定量;蛋白样品的定量;SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳;SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳;丙烯酰胺和N,N’-亚甲双丙烯酰胺(Bis) ??
聚合而成的分子筛,孔径大小由二者的总浓度及Bis的浓度决定。Bis一定的情况下,总浓度越高,孔径越小。
TEMED
过硫酸铵(APS)(时间)
TEMED 及APS激发网状结构的形成。分子氧阻止链的延长,防碍聚合作用。所以凝胶液需排气,在水或水饱合异丁醇隔绝空气的条件下反应。
SDS
配胶的Tris缓冲液
Tris-甘氨酸电泳缓冲液
;凝胶浓度与蛋白分离范围;浓缩胶浓缩蛋白质的原理;电泳时通常推荐在上层胶时使用低电压恒压电泳,而在溴酚蓝进入下层胶时使用高电压恒压电泳。
通常电泳时溴酚蓝到达胶的底端处附近即可停止电泳,或者可以根据预染蛋白质分子量标准的电泳情况,预计目的蛋白已经被适当分离后即可停止电泳。
**预染蛋白质分子量标准包含了从19kD到117kD共6种纯化的预染蓝色蛋白质,可以直接使用,无需煮沸。每次上样5-10微升,就可以在电泳时、电泳后或转膜后观察到非常清楚的蛋白条带。;1)电压,小的电压会使胶的分子筛效应得到充分发挥,电压越小,条带越漂亮。
;转膜;转膜 ;转膜后检测;封闭;封闭液选择;一抗、二抗孵育;回收一抗溶液?;一抗选择;二抗算不算多余?一抗不能显色吗? ;二抗与底物反应显色;DAB、 ECL法都能达到纳克的要求。ECL是一种增强显色法,灵敏度要高,但显色麻烦,发表文章常用。
DAB(3,3二氨基联苯胺)和HRP反应产生棕色的不溶终产物。这种棕色沉淀不溶于酒精和其它有机溶剂,对于必需使用传统复染和封固介质的免疫组化染色应用特别理想。
Ecl 显色原理:氨基苯二酰肼类主要是鲁米诺及异鲁米诺衍生物,是最常用的一类化学发光剂。鲁米诺在免疫测定中既可用作标记物,也可用作过氧化物酶的底物。在Ecl底物中,含有H2O2和鲁米诺,在HRP(辣根过氧化物酶)的作用下,发出荧光来。
注意:荧光在一段时间后会越来越弱。;成功的例子;杂交结果的分析;免疫组化可以用来进行定位,但是不能精确定量,有时会有假阳性。
免疫组化定量分析(半定量):用DAB对免疫组化产物染色,同时用苏木对细胞核进行复染。镜下观察样品,细胞核被染上了蓝色,胞浆间有黄色(强阳性的地方会呈现棕黄色)。根据细胞着色深度及阳性细胞数分别记分为0~3 分,着色深度以多数细胞呈色程度为准。常用软件进行处理,如image?pro?plus?5.0(IPP5)。 ;Western Blot常见问题分析;不恰当的样品制备会导致
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