类风湿关节炎患者外周血环状rna表达谱研究.pdf

主堡凰垂痘堂盘查2Q!鱼生S旦筮垫鲞簦§翅￡丛娶』丛!丛堂!Q!：△!艘煎堑!垒：y丛：垫：盟Q：S ·541· ·基础研究· 类风湿关节炎患者外周血环状RNA 表达谱研究 宋新强 张丽丽赵仕琪汪学群王磊陈磊 曾宪思 【摘要】目的筛选RA患者外周血中差异性表达的环状RNA(ciroRNA)并进行生物信息学分 析，以探讨外周血circRNA在RA发病中的作用。方法采用circRNA芯片对3例RA患者和3名健康对 照的外周血中的circRNA进行筛查，用R软件包对数据进行归一化及后续数据处理，通过Fold Change 和P值进行筛选，采用t检验，寻找2组样本间差异表达的circRNA，并对差异表达的circRNA进行生物 信息学分析。结果芯片筛查结果提示有36个circRNA在RA组和对照组之间差异有统计学意义，14个 c／rcRNA下调，22个circRNA上调。对这些circRNA所涉及的基因进行基因本体论(GO)分析，结果提示， 这些基因主要参与生物学调控、细胞分化、代谢过程等。对每个差异表达的circRNA的靶miRNA进行预 测，其中有1个eircRNA(hsa)预测结果中有1个 (a． ． cric_到得中献文在)p3． 验证，用 epaesotyCa5中21血R周im外s者h患ANRim论结。测预了行进系关79络35网00的0_间之者三对件软 RA 的eircRNA出现多 个差异性表达,circRNA可能参与RA调控机制。 【关键词】关节炎，类风湿；靶基因；生物信息学；环状RNA 基金项目：国家自然科学基金；河南省科技厅科技攻关项目(142102310050)；河南省教 育厅项目(148310010)；信阳师范学院大学生项目科研项目(2014) bloodCircRNA in arthritis Peripheral expressionprofileanalysispatients喇出rheumatoidSong Lili,Zhao Xinqiang；ZhangSh幻i,WangXuequ鸭WangLei，ChenLei,ZengXiansi．’CollegeofLifeSciences， Normal Xinyang University,He，啪464000．China Toscreenthe bloodcircRNA in with 【Abstract]Objective peripheral differenflyexpressedpatients rheumatoidarthritis to the roleof bloodcicRNAinRA faA)andexplorepathogenetie by pefilpheral analyzing thedatawithbioinformatics．MethodsThe was in3RAcasesand3 studyperformed healthycontrols，using circRNA to$ci_eenthecircRNAin bloodof withRA．Thedatawerenormalized microarrays peripheralpatients and Rsoft fold P