第五章 转录第二部分).ppt

真核生物的RNA转录 真核生物的启动子 类型I基因的启动子 类型II基因的启动子 类型III基因的启动子 类型I基因的启动子 RNA pol I转录生成18S、5.8S、28S rRNA 不同真核生物的rRNA转录起始位点邻近的序列是完全不同的，因此，RNA pol I启动子区域有较大的差异 rRNA基因具有显著的种属特异性 不同种属的rRNA调控区具有某些共同的特征 rRNA基因重复单位 拷贝区 外间区（ETS） 内间区（ITS） 非转录区（NTS） 核心序列（核心启动子） 人的rRNA的核心序列在-45—+20 小鼠的rRNA的核心序列在-45—+9 缺失、替代、突变都会消除或强烈降低rRNA转录能力 决定转录起始的精确位置 上游控制元件（UCE） -150— -107 缺失、置换、插入等破坏这一区段序列，可造成rRNA转录下降100倍。 类型II基因的启动子 （一）转录起始位点（Inr) （二）基本启动子 （三）转录起点上游元件 （四）转录起点下游元件 转录起始点 帽子位点（Cap site） PyPyANT/APyPy （Py=嘧啶C或T） 是转录的起始位点（Inr） 基本启动子 TATA box（Hogness box） TATAAAA，两侧富含GC 位于-26—-34，-30左右 决定转录起始的选择。 TATA box 有的真核基因中没有TATA box，如腺病毒DNA结合蛋白基因（27kd） TATA box的缺失使转录不能选择特定的起始位点，因而形成几种不同的5端的mRNA。如海胆H2A基因 TATA box突变会使转录频率大大下降 TATA突变 1、CAAT box GGC/TCAATCT 位于-75，-70—-80 开头两个G的重要性等于CAAT部分，非常保守 可能是真核生物RNA pol II的结合部位，决定转录起始的频率 CAAT box 缺失、突变会导致转录活性大大下降 兔β-珠蛋白启动子CAAT缺失、GGCCAATCT变成TTCCAATCT，则转录活性只剩12% CCAAT变为TCAAT，则转录活性只剩下25% 2、 GC box GGGCGG 位于-80—-110 GC区与sp1等转录因子结合，可提高转录起始的频率 类型III基因的启动子 （一）基因内启动子 （二）基因外启动子 （三）混合型启动子 （一）基因内启动子 编码tRNA、5SrRNA、Alu的大多数基因 5SrRNA基因内的启动子位于+55—+80，两端有A box和C box。 tRNA基因内启动子位于+8—+72之间，其中A box位于+8—+30，B box位于+51—+72 在真核生物内A、B、C box是相对保守的 基因内启动子决定转录的起始与否，而转录起始频率主要由转录起始点决定 （二） 基因外启动子 snRNA、U6和人的7SK RNA 位于被转录序列的上游 三种启动子元件： 1、TATA结构 2、近端序列元件（PSE）：-60bp 3、远端序列元件（DSE）：-250bp（增强子） （三）混合型启动子 海胆硒代半胱氨酸tRNA（ser）sec基因 酵母U6基因 真核基因的转录因子 原核生物RNA pol不需要其他蛋白质因子参与就能起始转录反应，而真核生物RNA pol需要一定的蛋白质才能起动转录反应。 TF的类型 1、通用的转录因子（普遍性转录因子） 结合于启动子核心序列 TFIIA、TFIIB、TFIID、TFIIE、TFIIIA、TFIIIB、TFIIIC 2、基因特异性转录因子 结合于上游调控区UPE和增强子区 SP1、CTF、Ap-1、Ap-2、Oct-2、CREB 广泛研究的TF 识别TATA区的TFIID 识别CAAT区的CTF 识别GC区的SP1 转录因子 一、RNA pol II的转录因子 二、RNA pol I的转录因子 三、RNA pol III的转录因子 参与RNA-pol Ⅱ转录的TFⅡ TFIID TFIID结合于TATA box TFIID由多种亚基组成，其中一种亚基称为TBP（TATA结合蛋白，TATA binding protein），是参与各种RNA pol起始复合物装配的必要组分。 TFIID的其余亚基称为TBP相关因子（TBP-associated factor，TAF） 定位因子TBP（相当于σ因子） SL1（pol I）；TFIID（pol II）；TFIIIB（pol III） RNA pol I的转录因子 3种转录因子：UBF、SL1、TF1C 终止： ● mRNA3′端转录出AAUAAA及富GU序列后，在AAUAAA后约11～13b的修饰点（processing）被切断，游离的mRNA戴帽、加尾。 蛋白激酶，使CTD磷酸化