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《分子生物学技术》学习要点.doc

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第二节分子生物学技术

【学习目标】

1.根据DNA复制的原理及过程,理解PCR技术的原理及过程。

2.掌握PCR技术的基本操作。

【学习重、难点】

重点

1.尝试PCR(DNA聚合酶链式反应)技术的基本操作。

2.理解PCR的原理,讨论PCR技术的应用。

难点

1.尝试PCR(DNA聚合酶链式反应)技术的基本操作。

2.体验PCR这一常规分子生物学实验方法。

【学习要点梳理】

一、PCR体外扩增DNA与生物体内DNA复制的比较

体内复制

PCR反应

不同点

解旋

在解旋酶的作用下,细胞提供能量,部分解开

加热至94℃左右,双链全部解开,不需解旋酶

引物

小段RNA

可以是RNA或单链DNA分子片段

不同点

合成子链

在引物基础上,一条链连续合成,另一条链不连续合成

分别从两条链的引物端开始,都是连续合成,控制温度在72℃左右

特点

边解旋边复制,半保留复制

体外迅速扩增

DNA

聚合酶

需要

需要TaqDNA

聚合酶

不同点

循环

次数

受生物体自身控制

30多次

温度

体内温和条件

高温(可变)

产物

完整DNA

DNA片段

相同点

①需提供DNA复制的模板

②以四种脱氧核苷酸为原料

③都需要一定的缓冲溶液

④子链延伸的方向都是从5′端到3′端

特别提醒①DNA母链的3′端对应着子链的5′端,即DNA的两条链是反向平行的。

②解旋酶的作用是使DNA两条链的氢键断开,而DNA聚合酶与DNA连接酶都可催化形成磷酸二酯键。

③DNA聚合酶是将单个核苷酸加到已有的单链片段的3′羟基上,需要模板,而DNA连接酶连接的是两条DNA片段的缺口,不需要模板。

④在PCR反应中,加入的四种脱氧核苷酸实际上是四种脱氧核苷三磷酸,既是原料,也是能源。

⑤在PCR反应中加入的Mg2+实际上是Taq聚合酶的激活剂。

二、PCR技术相关知识分析

1.PCR原理:DNA热变性的原理

双链DNA单链DNA

2.PCR引物

(1)引物是PCR特异性反应的关键,PCR产物的特异性取决于引物与模板DNA互补的程度。理论上,只要知道任何一段模板DNA序列,就能按其设计互补的寡核苷酸链作引物,利用PCR就可将模板DNA在体外大量扩增。

(2)引物3′端的碱基,特别是最末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,以避免因末端碱基不配对而导致PCR反应失败。

(3)引物的特异性:引物应与核酸序列数据库的其他序列无明显同源性。

3.PCR扩增的过程

(1)变性:当温度上升到94℃时,双链DNA解旋为单链,如下图:

(2)退火:温度下降至40~60℃左右时,两种引物通过碱基互补配对与两条单链DNA结合,如下图:

(3)延伸:当温度上升至72℃左右,溶液中的四种脱氧核苷酸在DNA聚合酶的作用下,根据碱基互补配对原则合成新的DNA链,如下图:

4.PCR扩增数目的理论计算

理论上DNA扩增呈指数增长,若只有一个DNA模板,则复制n次后有2n个DNA;若一开始有m个DNA模板,则复制n次后有m×2n个DNA。实际操作过程中,由于无关变量的影响,一般来说,实验值要略小于理论值。从第二轮循环开始,上一次循环的产物也作为模板参与反应,并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸,这样,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段序列呈指数扩增。

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