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油桐种子EST文库构建及FAD2等重要基因全长cDNA克隆的中期报告.docx

发布:2023-09-21约小于1千字共1页下载文档
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油桐种子EST文库构建及FAD2等重要基因全长cDNA克隆的中期报告 油桐(Triadica sebifera),是一种可生产高质量油脂的高经济价值植物,已被广泛研究。为了深入了解油桐基因组和代谢特征,本研究构建了油桐种子EST文库,并对一些基因进行了全长cDNA克隆。 油桐种子EST文库是通过用SMARTer? cDNA合成试剂盒合成RNA引物,进行反转录和纯化,构建低复杂度cDNA文库。经过质量控制和序列分析,得到了17118条高质量EST序列,其中包括10377个单向序列和6738个双向序列。 通过比对到公共数据库的BLAST分析表明,油桐种子EST序列的注释质量较好,有约66%的序列匹配到已知的基因或蛋白质序列,其中约20%的序列匹配到已知的无功能蛋白质序列。GO(Gene Ontology)注释显示,油桐种子EST序列涉及到多种生物过程、分子功能和细胞组分,与大部分植物基因组注释类似。 通过油桐EST序列,我们成功克隆了多个与油脂代谢相关的基因全长cDNA,其中包括FAD2(ω-6脂肪酸脱氢酶)等重要基因。通过对FAD2基因的生物信息学分析和功能鉴定,发现其编码的蛋白质是同甘三脂酯合成途径中必不可少的酶,可以将十四碳酸和十六碳酸转化为ω-6脂肪酸。该研究结果将有助于进一步阐明油桐油脂代谢途径,并为油桐的品种改良提供基础数据。
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