口蹄疫病毒感染PK-15细胞后细胞基因表达谱变化的分析的开题报告.docx

口蹄疫病毒感染PK-15细胞后细胞基因表达谱变化的分析的开题报告 一、课题背景 口蹄疫（Foot-and-mouth disease, FMD）是一种由口蹄疫病毒（Foot-and-mouth disease virus, FMDV）引起的急性、高度接触传播的疾病，其中感染后会导致牲畜口腔、鼻腔和蹄上出现病变。这种疾病对世界范围内的农业和经济有极大的影响，同时也对人类健康构成了威胁。 PK-15是猪肾细胞系的一种，广泛应用于病毒学研究中。目前，关于口蹄疫病毒感染PK-15细胞后细胞基因表达谱变化的研究还比较有限，因此需要展开探究。 二、研究目的 本研究旨在通过口蹄疫病毒感染PK-15细胞后的转录组学分析方法，探讨病毒感染后细胞基因表达谱的变化情况及相应的影响，为深入理解口蹄疫病毒感染机理提供理论支持。 三、研究内容和方法 1. 研究内容 （1）获取PK-15细胞株； （2）使用不同浓度的口蹄疫病毒感染PK-15细胞株，并观察病毒感染后细胞形态变化； （3）利用高通量测序技术（RNA-Seq）对感染组与未感染组进行转录组学分析，筛选出差异表达的基因； （4）进行GO和KEGG通路分析。 2. 研究方法 （1）PK-15细胞株的获取：通过向供应商购买相关试剂，培养并传代细胞，获取PK-15细胞株； （2）浓度选择和感染处理：将病毒在细胞上进行吸附并进行不同浓度的感染，观察细胞的形态变化，筛选出最适宜的病毒感染浓度； （3）RNA提取和测序：从感染组和未感染组中分别提取RNA，并进行RNA-Seq测序； （4）差异表达基因筛选和功能分析：利用数据库和相关软件进行GO和KEGG分析，筛选出差异基因并进行功能富集分析。 四、研究意义 本研究不仅能够深入探究口蹄疫病毒感染机理，还能为口蹄疫的疫苗及治疗药物的研发提供一定的理论基础，并对黄病毒等其他病毒的病理研究提供参考。