T_SZAS 92-2024 基于高通量测序技术的污水来源新型冠状病毒变异监测通用技术要求.docx
ICS07.100CCSA40
团体标准
T/SZAS92—2024
基于高通量测序技术的污水来源新型冠状病毒变异监测通用技术要求
GeneraltechnicalrequirementsformonitoringSARS-CoV-2variantsfromwastewaterbasedonhigh-throughputsequencingtechnology
2024-12-31发布2025-01-10实施
深圳市标准化协会发布
T/SZAS92—2024
I
目次
前言 II
1范围 1
2规范性引用文件 1
3术语和定义 1
4缩略语 3
5原理 3
6试验步骤 3
6.1污水样本类型 3
6.2污水监测点位的布设 4
6.3污水样本的采集 4
6.4污水样本的富集浓缩 5
6.5污水样本的核酸提取及新冠病毒核酸检测 5
6.6测序文库制备 5
6.7测序 5
6.8数据分析 6
7质量控制 6
7.1富集浓缩质量控制 6
7.2核酸提取质量控制 6
7.3PCR检测质量控制 6
7.4文库构建质量控制 7
7.5测序数据质量控制 7
7.6新冠病毒变异株株系丰度分析质量控制 7
附录A（规范性）实验条件、实验室分区要求 8
附录B（规范性）试验试剂、材料、仪器和设备要求 9
附录C（资料性）污水中新冠变异株株系分布和丰度分析示例 10
参考文献 12
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II
前言
本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定起草。
本文件由深圳市疾病预防控制中心提出。
本文件由粤港澳大湾区标准创新联盟归口。
本文件授权粤港澳大湾区标准创新联盟组织伙伴和所有成员单位使用，联盟组织伙伴需等同采用转化为自身团体标准，并在全国团体标准信息平台上公开标准基本信息。
请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。
本文件起草单位：深圳市疾病预防控制中心、香港大学、深圳华大智造科技股份有限公司、澳门科技大学、中国食品药品检定研究院、深圳大学、深圳万物传感科技有限公司、湖北国际旅行卫生保健中心（武汉海关口岸门诊部）、中国海关科学技术研究中心、深圳天祥质量技术服务有限公司。
本文件主要起草人：扈庆华、吕子全、付玉林、李迎慧、张彤、陈芳、王逸丛、黄锦伟、张晗、刘东来、杜琛、徐晓庆、龚睿、王艺凯、颜妙丽、苏凤侠、杨自飞、徐嘉铖、李兆新。
本文件为首次发布。
T/SZAS92—2024
1
基于高通量测序技术的污水来源新型冠状病毒变异监测通用技术要求
1范围
本文件规定了基于高通量测序技术的污水来源新冠病毒变异监测通用技术要求的原理、试验步骤及质量控制要求等。
本文件适用于污水样本中新型冠状病毒的富集浓缩、核酸提取、高通量测序及数据分析过程，其中高通量测序适用于可逆末端终止测序法和联合探针锚定聚合测序法等技术为主要技术原理的测序平台。
本文件不适用于：
——以桑格（Sanger）测序为主要技术原理的第一代基因测序领域；
——以单分子实时荧光测序法、单分子纳米孔链测序法、单分子纳米孔标签测序法等技术为主要技术原理的具有连续测序特征的单分子基因测序领域；
——宏基因组测序、探针捕获靶向测序。
2规范性引用文件
下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款。其中，注日期的引用文件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括所有的修改单）适用于本文件。
GB19489实验室生物安全通用要求
GB/T30989—2014高通量基因测序技术规程
WS/T799—2022污水中新型冠状病毒富集浓缩和核酸检测方法标准YY/T1723—2020高通量基因测序仪
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。3.1
污水wastewater
排入污水管网系统的污水的总称，主要来源包括居民区、学校、医院、商业服务机构及各种公共设施等。
3.2
新型冠状病毒severeacuterespiratorysyndromecoronavirus2
属于β属冠状病毒，基因组为线性单股正链