高通量测序仪原理.pdf
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高通量测序仪原理
与实际操作
汇报：郝淋淋
单位：中科院沈阳生态所
现代先进检测技术应用培训班
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1二代测序介绍
2高通量测序仪原理
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“计算生物学前沿”精品培训班-转录组深度分析
高通量测序原理及在转录组
全长分析中的应用
倪 挺
复旦大学生命科学学院
2016年10月24 日
提 纲
1. RNA-seq背景介绍
2. 二代、三代测序原理简介
3. RNA-seq实验方法简介
4. 从头到尾理解转录组
转录起始位点、反义R
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中国生物工程杂志 ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１２，３２（１）：１０９１１４
高通量测序技术及其应用
１，２ ３ １ １ ２
王兴春 杨致荣 王 敏 李 玮 李生才
（１山西农业大学生命科学学院 太谷 ０３０８０１ ２山西农业大学农学院 太谷 ０３０８０１）
（３山西农
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治疗不再是仅由肿瘤位置所决定，更多的是由病人和肿瘤的基因学决定。
——ASCO主席 Sandra Swain
我们在肿瘤和免疫细胞的重要靶标上越来越有
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高通量测序服务与数据分析服务简介;高通量测序简介;高通量测序数据分析简介;高通量测序服务适用范围;高通量测序数据分析服务适用范围;我们提供的测序服务内容（细致展开）;我们提供的数据分析服务（细致展开）;应用举例;;;高通量测序服务市场情况分析;1、美季生物。
-小型企业，偏重于454测序。
2、晶能科技。
-依托研究院所建立的高通量测序服务企业。有一定业务量，但不稳定。
3、其他类企业：
-还有一些小型企业，这些企业主要通过代理或只能承担小量样本测序，其服务流动性较大而且服务质量无法保证。
欣景生物科技则拥有成熟的测序与分析流程、经验丰富的分析人员，可以提供
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生工高通量测序服务.ppt
甲基化程度与基因表达的相关性 主要内容 高通量测序简介 高通量测序与传统技术比较 高通量测序平台的介绍 高通量测序的应用范围介绍 相关生物信息学分析软件介绍 常用生物信息学分析平台与资源 常用编程分析平台： Perl / BioPerl Python / BioPython R / Bioconductor JAVA / BioJava 常用网上资源： NCBI SRA – Sequence Read Archive UCSC Genome Browser SEQanswers – WiKi Forum for NGS 常用基因组拼接软件 Velvet Ray ABySS SOAPdeno
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常用生物信息学分析平台与资源 常用编程分析平台： Perl / BioPerl Python / BioPython R / Bioconductor JAVA / BioJava 常用网上资源： NCBI SRA – Sequence Read Archive UCSC Genome Browser SEQanswers – WiKi Forum for NGS 常用基因组拼接软件 Velvet Ray ABySS SOAPdenovo SSAKE SHARCGS MIRA Edena 基因组比对软件 BLAST BLAT MAQ SOAP Bowtie BWA SSAHA ELAN
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高通量测序的应用与进展1精要.ppt
宏基因组测序 宏基因组测序是对某一特定环境，如肠道、土壤、海水等中的所有微生物进行基因组测序。通过此方法可对该环境中的微生物种类和优势物种进行检测，揭示微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性、相互协作关系及与环境之间的关系 。自然环境中很多微生物无法分离培养，而此方法无需对微生物进行分离培养。 宏基因组测序方法现在有全基因组的宏基因组测序和16S/18S rRNA宏基因组测序。 全基因组的宏基因组测序 通过高通量测序技术，对环境样品的总 DNA 直接进行全基因组的宏基因组测序，能够实现微生物群落的物种分类研究、群落结构、系统进化、功能注释以及物种间的代谢网络研究，挖掘具有应用价值的基因
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高通量测序的应用与进展精要.ppt
报告纲要 高通量测序简介 高通量测序平台的介绍 高通量测序的应用范围及案例分析 相关生物信息学分析软件介绍 常用生物信息学分析平台与资源 常用编程分析平台： Perl / BioPerl Python / BioPython R / Bioconductor JAVA / BioJava 常用网上资源： NCBI SRA – Sequence Read Archive UCSC Genome Browser SEQanswers – WiKi Forum for NGS 常用基因组拼接软件 Velvet Ray ABySS SOAPdenovo SSAKE SHARCGS MIRA Ede
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高通量测序在肿瘤临床中的应用;目录;高通量测序技术发展简介;;生命科学在分子生物水平上的飞速发展;基因组测序帮助人类解读生命之书;;高通量测序技术的发展;现有主要高通量测序仪开发商;基因组测序技术的快速发展促使测序成本快速下降;高通量测序有什么用;高通量测序在临床方面的应用;高通量测序在肿瘤临床中的应用情况;肿瘤;肿瘤的特征;高通量测序在肿瘤临床中的应用;安吉丽娜·朱莉（Angelina Jolie，1975年6月4日－），好莱坞著名电影明星、社会活动家、联合国高级难民署特使。曾获得72届奥斯卡最佳女配角，81届奥斯卡最佳女主角提名。2005年当选世界著名男性杂志《男人帮》一年一度的百大性感女
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高通量测序常用名词汇总.docx
高通量测序常用名词汇总
技术支持
Q20值是指的测序过程碱基识别〔BaseCalling〕过程中,对所识别的碱基给出的错误概率.
如果质量值是Q20,那么错误识别的概率是1%,即错误率1%,或者正确率是99%；
如果质量值是Q30,那么错误识别的概率是0.1%,即错误率0.1%,或者正确率是99.9%；
如果质量值是Q40,那么错误识别的概率是0.01%,即错误率0.01%,或者正确率是99.99%；
你发现规律没有,Q“N”0的质量值,就是正确率有N个9的百分比,这样就非常容易记忆了.
基因高通量测序中，每测一个碱基会给出一个相应的质量值，这个质量值是衡量测序准确度的。碱基的质量值13，错误
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新一代测序技术〔ＮＧＳ〕
——加速肿瘤个体化诊疗进程;
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基因突变和过高或过低基因表达是大多数慢性疾病发生的分子根底〔系统，标准，标准〕;基因突变和过高或过低基因表达是大多数慢性疾病发生的分子根底
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治疗不再是仅由肿瘤位置所决定，更多的是由病人和肿瘤的基因学决定。
——ASCO主席SandraSwain
我们在肿瘤和免疫细胞的重要靶标上越来越有更好的目标。
——ASCO癌症交流委员会主席
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高通量测序对gwas的应用.pdf
中国科学: 生命科学 2012 年 第42 卷 第2 期: 107 ~ 124
SCIENTIA SINICA Vitae SCIENCE CHINA PRESS
评述
高通量测序技术在动植物研究领域中的应用
† † *
岳桂东, 高强,
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高通量测序技术简介
高通量测序技术简介高通量测序技术又称“下一代”测序技术，以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。目前用于微生物群落多样性研究的高通量测序平台主要有来自罗氏公司的454法、Illumina公司Solexa法和ABI的SOLiD法
罗氏454法测序原理GSFLX系统的测序原理是基于焦磷酸测序法，依靠生物发光对DNA序列进行检测。在DNA聚合酶，ATP硫酸化酶，荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下，GSFLX系统将引物上每一个dNTP的聚合与一次荧光信号释放偶联起来。通过检测荧光信号释放的有无和强度，就可以到达实时测定DNA序列的目的。
罗氏454法
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2测序原理跟数据分析(华大基因高通量测序内部培训资料).pdf
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