高通量测序原理及在转录组 全长分析中的应用.pdf

“计算生物学前沿”精品培训班-转录组深度分析 高通量测序原理及在转录组 全长分析中的应用 倪 挺 复旦大学生命科学学院 2016年10月24 日 提 纲 1. RNA-seq背景介绍 2. 二代、三代测序原理简介 3. RNA-seq实验方法简介 4. 从头到尾理解转录组 转录起始位点、反义RNA调控及3 ´末端形成 RNA-seq背景介绍 基因和环境共同作用决定表型 DNA sequencing 基因型 中心法则： 影响基因表达 RNA-seq 基因表达 环境 产生蛋白质 表观遗传： DNA 甲基化、 组蛋白修饰等 ChIP-seq 表型 中心法则是现代分子生物学最重要的基本规律 DNA 复制 转录调控是基因 逆转录 转录 表达最重要的 调控手段之一 RNA 复制 翻译 Protein 编码基因的表达涉及众多过程 intron exon Transcription Pre-mRNA Pre-mRNA processing: Capping Splicing 基因表达过程 Mature mRNA Polyadenylation 任何一个环节 AAAn 的调控失衡均 (Human: n=200-250; 可导致疾病。 Yeast: n=~70) Export Localization AAAn Degradation Translation