长链非编码RNA的研究现状-生物通.PDF

中国生物工程杂志　ＣｈｉｎａＢｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，２０１６，３６（９）：５９７４ ＤＯＩ：１０．１３５２３／ｊ．ｃｂ 长链非编码ＲＮＡ的研究现状   堵晶晶　谭镇东　刘辰东　巫小倩　张培文　张顺华 　朱　砺 （四川农业大学动物科技学院　成都　６１１１３０） 摘要　长链非编码ＲＮＡ（ｌｎｃＲＮＡ）是一类长度大于２００ｂｐ的非编码ＲＮＡ，无蛋白质编码功能，物 种间保守性差，具有较强的组织特异性和时空特异性。研究表明ｎｃＲＮＡ具有广泛的生物学功能， 如参与ＲＮＡ的生成与加工、转录调控、染色质重塑等，且作用机制复杂，如能通过绑定特点蛋白质 参与转录调节或作为ｃｅＲＮＡ参与转录后调控。但ｌｎｃＲＮＡ的结构复杂，功能研究进展缓慢，目前 仍难以对其细致分类。从基本特征、分类、功能、数据库、研究工具及其与癌症之间的关系等方面 对ｌｎｃＲＮＡ的研究进展进行综述，以期为ｌｎｃＲＮＡ后续研究提供参考。 关键词　非编码ＲＮＡ　ｌｎｃＲＮＡ　分类　功能　癌症 中图分类号　Ｑ５２２ 　　蛋白质是基因功能的执行者，ＲＮＡ在蛋白质合成 ｌｎｃＲＮＡ的功能研究一直进 于技术手段和工具的限制， 过程中扮演着重要作用。ＲＮＡ可分为两类，一类为具 展缓慢，人们对其基本特征、分类、功能等方面的认识 有蛋白质编码功能的编码 ＲＮＡ（ｃｏｄｉｎｇＲＮＡ），另一类 也较为滞后。为此，本文主要从 ｌｎｃＲＮＡ的基本特征、 为不具有蛋白质编码功能的非编码 ＲＮＡ（ｎｏｎｃｏｄｉｎｇ 分类、功能、相关的数据库、研究方法及其与癌症之间 ＲＮＡ，ｎｃＲＮＡ）。与蛋白质编码ＲＮＡ相比，ｎｃＲＮＡ在很 的关系等进行综述，全面展现ｌｎｃＲＮＡ的研究进展。 长一段时间里都被当做转录的副产物。直到１９９０年， １　ｌｎｃＲＮＡ的特征 ＲＮＡ干扰（ＲＮＡｉ）的首次发现才引起研究者对 ｎｃＲＮＡ ［１］ 　　长度大于２００ｂｐ（２００ｂｐ～１００ｋｂｐ）、无蛋白质编码 功能的关注 。随着深度测序技术的迅猛发展，人们 惊奇地发现，在哺乳动物中编码蛋白质的基因仅约占 功能是 ｌｎｃＲＮＡ最基本的特征［１８２０］。与编码 ＲＮＡ相 全基因组的２％，全基因组的７０％最终转录为无编码蛋 比，广泛存在于哺乳动物中的ｌｎｃＲＮＡ拥有更少外显 白质功能的非编码 ＲＮＡ，如转运 ＲＮＡ（ｔＲＮＡ）、核糖体 子，缺少开放阅读框（ｏｐｅｎｒｅａｄｉｎｇｆｒａｍｅ，ＯＲＦ）及典型 ＲＮＡ（ｒＲＮＡ）、ｓｍａｌｌｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、ｍｉｃｒｏＲＮＡ 的起始密码子和终止子。研究者推论这可能是ｌｎｃＲＮＡ （ｍｉＲＮＡ）、小核ＲＮＡ（ｓｎＲＮＡ）和长链非编码ＲＮＡ（ｌｏｎｇ 不能编码蛋白质的原因［２１２６］。ｌｎｃＲＮＡ也有许多类似 ［２６］ 于ｍＲＮＡ的特征，如绝大多数ｌｎｃＲＮＡ拥有５′帽子结构 ｎｏｎｃｏｄｉｎｇＲＮＡ，ｌｎｃＲＮＡ）等 。截 至 目前，如 和ｐｏｌｙＡ尾巴，由ＲＮＡ转录酶 转录，并经多聚腺苷酸 ｍｉＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ等ｎｃＲＮＡ的生物学特性、功能及其分子 Ⅱ ［７１６］ 化、ｐｒｅＲＮＡ拼接在内的共转录修饰［２７２８］。 作用机制已被基本阐释清楚 。 　　ｌｎｃＲＮＡ与蛋白质编码 ｍＲＮＡ在结构上存在许多 　　ｌｎｃＲＮＡ在细胞质、