微阵列比较基因组杂交技术检测不明原因智力低下_发育迟缓患儿的基因组拷贝数变异.pdf

中国循证儿科杂志 　2 0 10 年 3 月第 5 卷第 2 期 ·85 · ·论著 · DO I: 10. 3 9 6 9 / j. issn. 16 7 3 5 50 1. 2 0 10. 02. 0 02 微阵列比较基因组杂交技术检测不明原因 智力低下 /发育迟缓患儿的基因组拷贝数变异 1 1 2 2 3 1 4 , 5 陈晓丽 　郭 　金 　王 　珺 　王立文 　丁秀原 　张 　霆 　吴柏林 ( ) 　　摘要 　目的 　应用高分辨微阵列比较基因组杂交技术 A rrayCGH ,对中国人群不明原因的智力低下 /发育迟缓 ( ) ( ) MR /DD 患儿进行全基因组拷贝数变异 CNV s 筛查 ,获得在这些不明原因 MR /DD 患儿中 CNV s的检出率 ,并分析其中 的罕见 CNV s与 MR /DD 的相关性 , 以此评估 A rrayCGH 对不明原因 MR /DD 可能的遗传病因诊断作用 。方法 　根据特定 筛选条件收集在首都儿科研究所临床诊断为不明原因 MR /DD 患儿 ,用 O ligo 244 K DNA 芯片筛查全基因组 CNV s。针对 ( ) 所发现的 CNV s,首先将其与国际基因组 CNV s多态性数据库 database of genom ic variants 进行 比对 , 剔除常见多态性 CNV s,将获得的罕见 CNV s应用美国波士顿儿童医院遗传诊断实验室的临床分子诊断平台 ,结合基因组异常拷贝数数据库 ( ) D EC IPH ER 进行核查并与既往相关文献比对 , 以发现罕见 CNV s在不明原因 MR /DD 患儿中的检出率 。结果 　2004 年 7 月至 2008年 7月共收集 111例不明原因 MR /DD 患儿 ,平均年龄为 6 岁 , 男女比例为 1. 775。28 例患儿发现 36 个罕见 CNV s, CNV s平均长度为 1 326 kb (29～8 760 kb) ,这些 CNV s均无法被常规染色体 G带检查所识别 。通过评估 , 19例患儿 携带可能与 MR /DD 相关的 CNV s,另 1例患儿的 CNV s临床意义不明确 , A rrayCGH 在不明原因 MR /DD 患儿中发现携带 ( ) ( ) 与疾病相关的罕见 CNV s的诊断率为 17. 1% 19 / 111例 。22 / 36个 66. 1% 罕见 CNV s 曾被美国波士顿儿童医院 A rray CGH 数据库 、D EC IPH ER 数据库 、既往 MR /DD 微阵列研究文献所报道 。1例患儿在 15q11. 2 - 13. 1存在 2 098 kb 的基因 组缺失 ,覆盖 PraderW illi综合征 /A ngelm an综合征关键区的多个候选基因 ,包括 SN R PN 、N ECD IN 、S nRNA s和 UB E3A ,结合 该患儿面部表