数据库mouse genome informatics小鼠基因组介绍-peaker.pdf

automated querying of genome databases基因组数据库的自动查询.pdf Education Automated Querying of Genome Databases Peter Schattner (GenBank), the Expressed Sequence Tag Database (dbEST), etc. [3]—each wi

2017-08-30 约3.61万字 6页立即下载

数据库phenomicdb多物种表型相关介绍-peaker.pdf #数据库#PhenomicDB多物种表型相关数据库介绍 Peaker PhenomicDB是一个收录了多个组织相关表型-型关系的数据库，包括人类、小鼠、果蝇、C。线虫和其他模式生物。包含注释(NCBIgene)和orthologues(同样的在不同的物种) HomoloGene，允许用户比较同一在不同物种中参与影响的表型信息。PhenomicDB的数据来自多个主要的公开数据库: FlyBase,Flyrnai.org,WormBase,Phenobank,CYGD,MatDB,OMIM,MGI, ZFIN,SGD,DictyBase,NCBIgene,HomoloGene。 数据库主页

2025-04-25 约2.74千字 5页立即下载

2025-05-11 约3.42千字 6页立即下载

the case for cloud computing in genome informatics云计算在基因组信息学.pdf Stein Genome Biology 2010, 11:207 /2010/11/5/207 R E V I E W The case for cloud computing in genome informatics Lincoln D Stein* Abstract With DNA sequencing now getting cheaper more quickly than data storage or computation, the time may have come for genome informatics to migrat

2017-09-10 约5.36万字 7页立即下载

生物信息学十ACEDB个基因组信息的数据库.doc 第十三章 ACEDB一个基因组信息的数据库 ACEDB的一般特点 ACEDB(一种线虫C.elegans)是一种被广泛应用的管理和提供基因组数据的工具组。它是在1991年由Richard Durbin和Jean Thierry-Mieg首先提供的，他们发展它来支持和整理C.elegans1和2条。后续的程序由Durbin和Thierry-Mieg编制和完善，还有许多其他人参与了代码的编制。这一时期，ACEDB适用于许多动物和植物的基因组计划[3]。软件对于“非基因组”信息的计划仍然有效，诸如，民族植物学的数据、基因命名法、具体的文献等[4，5]。准确估计基于ACEDB资源的出版物很困难，1

2017-03-26 约1.43万字 13页立即下载

家蚕基因组数据库的构建及应用的开题报告.docx 家蚕基因组数据库的构建及应用的开题报告一、选题背景家蚕（Bombyxmori）是世界上最重要的经济昆虫之一，因其具有较高的纺丝品质和产茧能力而被广泛饲养。随着基础研究和实践应用的深入，越来越多的家蚕基因和分子机制被研究和发现。因此，建立家蚕基因组数据库，对于促进家蚕分子生物学和遗传学的研究具有重要的意义。二、研究内容 1.家蚕基因组测序及组装利用现有技术对家蚕基因组进行测序，将测序数据进行组装，获得家蚕基因组序列并进行注释。 2.家蚕基因组数据库构建将家蚕基因组序列及注释进行整合，构建家蚕基因组数据库。同时，开发网页端和客户端数据库访问工具，实现对家蚕基因组数据库的查询、浏览和下载。

2024-04-22 约1.51千字 3页立即下载

数据库source一个整合多平台信息综合-peaker.pdf #数据库#SOURCE——一个整合多平台信息的综合数据库 Peaker SOURCE是一个动态收集和编码来自多个科学数据库数据的统一平台，因而目的是收集遗传学和分子生物学信息，这些信息来自于不同的物种，包括人类，小鼠，大鼠，褐家鼠等。 SOURCE的任务是提供一个唯一的科学信息资源平台，所有的数据都是开放可供

2025-05-16 约2.13千字 5页立即下载

生物科学专业信息资源推介数据库名称BGI家蚕基因组数据库BGI.doc 生物科学专业信息资源推介 数据库名称BGI家蚕基因组数据库 BGISilkworm Database数据库网址/数据库简介家蚕基因组有28条染色体，约4.8亿碱基对，估计有基因4万个。2003年11月，中科院华大基因和西南农大等单位已率先完成家蚕基因组框架图绘制工作，在此基础上构架家蚕基因组数据库系统。包括国际最全的家蚕基因组研究数据，包括突变体、EST、基因、重复序列等基因组信息。服务方式：查询、免费下载。关键字家蚕基因组数据库名称韩国大米基因组数据库Korea Rice Genome Database数据库网址http://bioserver.myongji.ac.kr/ricemac

2017-04-19 约1.02万字 6页立即下载

全基因组核小体定位数据库与卵巢癌多组学数据库构建：方法、应用与展望.docx 全基因组核小体定位数据库与卵巢癌多组学数据库构建：方法、应用与展望一、引言 1.1研究背景与意义在生命科学的广袤领域中，全基因组核小体定位与卵巢癌多组学研究犹如两颗璀璨的明星，各自散发着独特的光芒，又相互交织，为我们深入理解生命奥秘和攻克重大疾病难题提供了关键的线索与路径。核小体作为染色质的基本结构单位，由147bp的DNA缠绕在由H2A、H2B、H3和H4各两个分子组成的八聚体核心上形成，其在基因组上的精确位置对基因表达起着关键的调控作用。从分子机制层面来看，核小体的定位决定了转录因子与DNA的结合能力，进而影响基因转录的起始、延伸和终止过程。当核小体处于基因启动

2025-05-01 约3.69万字 28页立即下载

基因组学理论课第四节 数据库与数据检索.pptx 第四节数据库与数据检索;一、重要生物信息中心简介;1．分子生物信息数据库发展简史;1982年，第一个DNA序列数据库在欧洲分子生物学实验室（EMBL）诞生，随即就开始了一个数据库爆炸的时代。不久，美国洛斯阿拉莫斯（LosAlamos）国家实验室建立了GenBank。1988年，美国组建了国家生物技术信息中心（NationalCenterforBiotechnologyInformation，NCBI），并正式接管了GenBank。日本的DNA数据库（DDBJ）于1984年在三岛市建成。 GenBank、EMBL和DDBJ现在已组成国际核苷酸序列数据库合作体，每日进行数据交换。;2．分子生物

2025-03-22 约2.92千字 81页立即下载

基因组学理论课第四节 数据库与数据检索.ppt （2）EMBL是一个非盈利的科研组织，由分布于德国、法国、英国和意大利的五个分支机构的共80多个从事分子生物学研究的科研团队组成。EMBL的核酸序列数据库始建于1980年，现由欧洲生物信息学研究所维护。查询检索可以通过互联网上的序列提取系统（SRS）服务完成。向EMBL核酸序列数据库提交序列可以通过基于Web的WEBIN工具，也可以用Sequin软件来完成。（3）DDBJ日本DNA数据库（DDBJ）由日本国家遗传学研究所（theNationalInstituteofGenetics，NIG）于1986年建立，也是一个全面的核酸序列数据库；可以使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析，

2025-03-13 约4.97千字 81页立即下载

大型海藻基因组生物信息数据分析与数据库的构建.docx 大型海藻基因组生物信息数据分析与数据库的构建一、引言随着生物信息技术的飞速发展，基因组学已成为生命科学研究的重要领域。大型海藻作为海洋生态系统的重要组成部分，其基因组研究对于理解海洋生物多样性、生态适应性以及海洋环境变化具有重要意义。本文旨在介绍大型海藻基因组生物信息数据分析的方法和流程，并探讨如何构建高效、实用的数据库来存储和共享这些数据。二、大型海藻基因组生物信息数据分析 1.数据来源与预处理大型海藻基因组数据主要来源于高通量测序技术。在获得原始测序数据后，需要进行质量评估、序列比对等预处理工作，以确保数据的准确性和可靠性。 2.基因组注释与分析 基因组注释是生物信息数据分析的

2025-01-21 约4.82千字 10页立即下载

数据库将很快充满来自2.5万种肿瘤的基因组序列，为此，《自然》杂志.doc 数据库将很快充满来自2.5万种肿瘤的基因组序列，为此，《自然》杂志编辑海蒂·莱德福（Heidi Ledford）撰文称：研究者把所面对的障碍看作是他们在数据中寻求其意义的所在—— 大科学：癌基因组面对的挑战马晋平林建伟/编译 IDH1浮出水面在2006年的一项针对35例结/直肠癌的研究中，研究人员首次发现了IDH1基因突变。当时觉得意义似乎并不大，它仅在其中的一个肿瘤标本中出现；在此后的300多例肿瘤分析中，也没有发现IDH1显示出更高的突变。曾参与这一研究的约翰·霍普金斯大学悉尼金梅尔综合癌症中心的研究员维克托·韦尔库列斯库（Victor Velculescu）说：“当时，没有人会

2017-03-03 约3.19千字 5页立即下载

一种构建病原生物基因组数据库的方法及装置.pdf (19)国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 115346608 A (43)申请公布日 2022.11.15 (21)申请号 202210743555.X (22)申请日 2022.06.27 (71)申请人北京吉因加科技有限

2023-05-09 约1.89万字 16页立即下载

能源微生物功能基因组的整合分析数据库用户使用指南.pdf [编号] 能源微生物功能基因组的整合分析 数据库 用户使用指南中国科学院青岛生物能源与过程研究所崔球张华仁

2017-08-18 约2.3万字 31页立即下载