生物科学专业信息资源推介数据库名称BGI家蚕基因组数据库BGI.doc

生物科学专业信息资源推介 数据库名称BGI家蚕基因组数据库 BGISilkworm Database数据库网址/数据库简介家蚕基因组有28条染色体，约4.8亿碱基对，估计有基因4万个。2003年11月，中科院华大基因和西南农大等单位已率先完成家蚕基因组框架图绘制工作，在此基础上构架家蚕基因组数据库系统。包括国际最全的家蚕基因组研究数据，包括突变体、EST、基因、重复序列等基因组信息。服务方式：查询、免费下载。关键字家蚕基因组数据库名称韩国大米基因组数据库Korea Rice Genome Database数据库网址http://bioserver.myongji.ac.kr/ricemac.html数据库简介KRGD是韩国大米的基因数据库，它搜集有关韩国大米的所有基因。数据库提供的EST序列查找能够快速找到所要研究的基因的EST。数据库还提供韩国大米的基因图谱，帮助相对准确地在基因组染色体上找到基因的定位。KRGD目前由韩国Myongji大学的生物科学系负责维护管理。服务方式：查询、免费下载。关键字Korea 韩国rice大米genome 基因组数据库名称线虫基因组数据库AceDB数据库网址/数据库简介AceDB是于1989年最初由Jean ThierryMieg和Richard Durbin开发的一个基因组数据库系统。它提供一个自定义数据库核心和一个特别设计的非标准数据模型以便灵活地处理科学数据，以及一个绘图用户界面和许多特别的显示和基因组数据处理工具。AceDB用于管理基因组计划内的数据和使基因组数据供科学界使用。服务方式：查询、分析、免费下载。关键字AceDBgenome基因组数据库名称线虫基因组预测蛋白数据库 WormPep  C.elegans Proteins db数据库网址http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep/数据库简介Wormpep 包括了线虫基因组中所有预测蛋白。在线虫基因组数据库AceDB的基础上,它共有9,745,258个碱基长度的基因预测的22,246个蛋白序列(其中1705个蛋白具有不同的剪接本)。搜寻方式可以使用蛋白序列、对应cDNA序列、序列的CDS编码和位置数据、蛋白的TREMBL或Swiss－Prot编码等。另外，提供基于BLAST的同源比对。本数据库由线虫基因组计划衍生出来，主要数据由英国Sanger中心、美国圣路易斯测序中心提供和更新。服务方式：查询、分析、免费下载。关键字elegan worm线虫predicted protein预测蛋白数据库名称盘基网柄菌基因组数据库 DictyDb －Dictyostelium discoideum Genome Database数据库网址/数据库简介盘基网柄菌基因组，包括染色体以及线粒体的全部基因组数据库, 在细胞粘菌中，由于盘基网柄菌的生活史最简单，且发育阶段分明，是极好的研究材料。该数据库不仅提供了盘基网柄菌的基因组信息，还为盘基网柄菌的序列提供了，已知及同源的基因列表，BLAST服务器，染色体定位图，已完成和进行中的基因敲除变异种的粘菌资料。并提供了相关的盘基网柄菌cDNA文库的链接及使用说明。该数据库由加州UCSD大学的发育基因项目（DGP）支持。服务方式：查询、免费下载。关键字盘基网柄菌genome基因组数据库名称枯草杆菌基因组数据库 BSORFBacillus subtilis Genome Database数据库网址http://bacillus.genome.ad.jp/数据库简介枯草杆菌基因组数据库是由日本枯草杆菌协会建立的专业数据库。该数据库收集的数据主要分为两类：以彩色图谱显示的基因组图谱以及以列表形式出现的其他来源数据，如突变信息、DNA芯片数据。用户可以通过输入基因名称、描述性字眼、分类号等方式进行查询，也可以直接输入序列检索是否是枯草杆菌的基因组序列或基因组中的编码序列。该数据库最近一次更新于2003年9月。服务方式：查询。关键字B. subtilis枯草杆菌genome 基因组数据库名称枯草杆菌基因组信息数据库 Bacillus subtilis Genetic Database数据库网址http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/数据库简介该数据库介绍了枯草杆菌基因组的各方面信息，它包含了B. subtilis 168（枯草杆菌的模式菌种）4,214,630bp DNA，蛋白质序列以及相关基因的注释和功能推测。该数据库的信息主要来源于EMBL/GenBank/DDBJ 数据库以及发表在国际杂志上或者相关方面科研工作者的报告，主要由Institut Pasteur维护（法国的一个私人的非盈利性的疾病预防基金会），它提