牛PPP1R3基因家族的生物信息学分析及其在PPP1R3C基因mRNA表达水平中的作用.docx
牛PPP1R3基因家族的生物信息学分析及其在PPP1R3C基因mRNA表达水平中的作用
目录
内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.2研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.3文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
牛PPP1R3基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1PPP1R3基因家族定义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.2PPP1R3基因家族结构特点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.3国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
3.1序列比对分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
3.2进化树构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.3同源性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.4系统发育分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
3.5功能域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
牛PPP1R3基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.1基因识别标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
4.2候选基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
4.3序列比对结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
牛PPP1R3基因家族结构与功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
5.1各成员结构特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20
5.2各成员功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
5.3与其他物种比较分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
牛PPP1R3基因家族在生长发育中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
6.1生长发育阶段分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
6.2生长发育与基因表达相关性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
牛PPP1R3基因家族在疾病发生中的角色．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
7.1疾病相关基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
7.2疾病模型建立与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
牛PPP1R3基因家族在生理过程中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
8.1生理过程与基因表达关系探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
8.2生理过程中的关键基因筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
牛PPP1R3基因家族在环境适应性中的体现．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
9.1环境适应性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
9.2适应机制与基因表达相关性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33
10.牛PPP1R3基因家族在育种中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34
10.1育种策略与目标基因选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
10.2育种效果评估与改进．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36
牛PPP1R3基因家族在分子育种中的作用．．．．．．．．．．．．．