sas系统数据分析示例.pdf
SAS数据分析示例
如果您对数据光盘中已有筛选过的差异数据表,这些文件上传到您的SAS帐户
以后,可以直接用来数据分析及注释等。
第一类无生物学重复的样本
处理
A
对照
处理处理
BA+B
示例说明:4个细胞样本,1个为对照,3个为3种不同方法处理的样本,每种处理1
个样本,无生物学重复。
分析方案:分别将处理样本与对照样本进行比较,用foldchange进行计算,建议阈值设
定为foldchange2或更高。对照样本的列设为1,处理样本的列设为2,设定差
异倍数的阈值来筛选差异,然后用筛选出来的结果进行Anntoation注释。
第二类两组样本,有生物学重复
1/2
示例说明:两组临床样本,分别是5个的癌和癌旁组织,每组有5个生物学重
复(应满足每组至少有3个样本)。
分析方案:采用diffgene计算差异,将第一组5个样本的列设为1,第二组5
个样本的列设为2,通过设定pvalue的范围来筛选差异显著的,在所得的计算
结果中有foldchange列,通过筛选数据的功能设定差异倍数来挑选差异,然后用筛
选得到的结果进行annotation注释。
第三类两组以上样本,有生物学重复
示例说明:三组同一株植物自不同部位的样本(、叶片和根),每组内有三个
生物学重复。
分析方案:采用OnewayANOVA进行计算,将第一组3个样本的列设为1,第二组、
伯豪生物技术
2016年1月
2/2