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SAS数据分析示例

如果您对数据光盘中已有筛选过的差异数据表,这些文件上传到您的SAS帐户

以后,可以直接用来数据分析及注释等。

第一类无生物学重复的样本

处理

A

对照

处理处理

BA+B

示例说明:4个细胞样本,1个为对照,3个为3种不同方法处理的样本,每种处理1

个样本,无生物学重复。

分析方案:分别将处理样本与对照样本进行比较,用foldchange进行计算,建议阈值设

定为foldchange2或更高。对照样本的列设为1,处理样本的列设为2,设定差

异倍数的阈值来筛选差异,然后用筛选出来的结果进行Anntoation注释。

第二类两组样本,有生物学重复

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示例说明:两组临床样本,分别是5个的癌和癌旁组织,每组有5个生物学重

复(应满足每组至少有3个样本)。

分析方案:采用diffgene计算差异,将第一组5个样本的列设为1,第二组5

个样本的列设为2,通过设定pvalue的范围来筛选差异显著的,在所得的计算

结果中有foldchange列,通过筛选数据的功能设定差异倍数来挑选差异,然后用筛

选得到的结果进行annotation注释。

第三类两组以上样本,有生物学重复

示例说明:三组同一株植物自不同部位的样本(、叶片和根),每组内有三个

生物学重复。

分析方案:采用OnewayANOVA进行计算,将第一组3个样本的列设为1,第二组、

伯豪生物技术

2016年1月

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