DB45T 2138-2020 水体中诺如病毒的核酸检测方法 实时荧光RT-PCR 法.pdf
ICS11.020
C51
DB45
广西壮族自治区地方标准
DB45/T2138—2020
水体中诺如病毒的核酸检测方法
实时荧光RT-PCR法
Detectionofnorovirusnucleotideacidinwater—Real-timeRT-PCR
2020-07-24发布2020-08-20实施
广西壮族自治区市场监督管理局发布
DB45/T2138—2020
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
本标准由广西壮族自治区卫生健康委员会提出并宣贯。
本标准由广西壮族自治区卫生技术标准委员会归口。
本标准起草单位:广西壮族自治区疾病预防控制中心。
本标准主要起草人:刘巍、邓丽丽、谭冬梅、马宇燕、钟革、李秀桂。
Ⅰ
水体中诺如病毒的核酸检测方法实时荧光RT-PCR法
1范围
本标准规定了水体中诺如病毒的实时荧光RT-PCR检测方法。
本标准适用于广西区域内地表水、地下水、集中式供水、娱乐用水、污水等水体中基因Ⅰ组和基因
Ⅱ组诺如病毒的检测。
2术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
2.1
诺如病毒Norovirus
世界范围内引起急性胃肠炎暴发和散发的重要病原体。大多数诺如病毒引起的水源性暴发疫情是由
于饮用水或生活用水被污染所致。诺如病毒属于人类杯状病毒科的诺如病毒属,是一组形态相似、抗原
性略有不同的病毒颗粒。诺如病毒直径26nm~35nm,无包膜,表面粗糙,球形,呈二十面体对称。诺
如病毒基因组是单股正链RNA,全长7.5kb~7.7kb,根据基因特征,诺如病毒被分为6个基因组
(genogroup,GⅠ~GⅣ),GⅠ和GⅡ是引起人类急性胃肠炎的两个主要基因组,GⅣ也可感染人,
但很少被检出。
2.2
实时荧光逆转录-聚合酶链式反应Real-timeRT-PCR
在RT-PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过Ct值对模
板进行定性。
2.3
Ct值Cyclethresholdvalue
每个PCR反应管内荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。各模板的Ct值与该模板的起始拷贝
数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。反之亦然。
3原理
水样在通过带负离子混合纤维素膜时,带正离子的病毒被吸附到膜上,然后再洗脱病毒,并用聚乙
二醇沉淀病毒达到富集浓缩的效果。应用实时荧光RT-PCR技术,针对诺如病毒衣壳蛋白区N/S区设计特
异性引物和探针,荧光探针的5’端标记报告荧光基团,3’端标记淬灭荧光基团,当探针完整时,报告
荧光基团的发射波长被淬灭荧光基团的激发波长吸收;当PCR扩增时,Taq酶的5’→3’端外切酶活性将
探针酶切水解,报告荧光不再受淬灭荧光的影响,使荧光监测系统收集到报告基团的荧光信号,即每扩
增一条DNA链,可产生一个报告基团的荧光信号,实现荧光信号积累与PCR产物形成同步。
4试剂和耗材
4.1试剂
4.1.1除另有说明外,本文件所使用的试剂均为分析纯,分子生物学试剂所用水为无RNA酶的水。
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DB45/T20382020
4.1.22.5mol/L氯化镁(MgCl2)溶液,配制遵照附录A中的A.1执行。
4.1.33%牛肉浸膏洗脱液,配制遵照附录A中的A.2执行。
4.1.416%PEG8000溶液,配制遵照附录A中的A.3执行。
4.1.50.2mol/L的Na