上海地区不同植物根际荧光假单胞菌多样性.pdf

( ) 第 3 7卷 第 2期 　　　　　　　　　　 　　　　　上海师范大学学报 自然科学版 Vol. 3 7 , No. 2 ( ) 2 0 0 8 年 4 月　　　　　　　　　　 Jou rnal of Shanghai Norm al Un iversity N atural Sciences 2 0 0 8 , Ap r 上海地区不同植物根际荧光假单胞菌多样性 张文茹 , 白　燕 ,彭 　 , 肖　明 (上海师范大学 生命与环境科学学院 , 上海 200234) 摘 　要 : 荧光假单胞菌是一种常见的植物根际促生细菌 ,有开发作为生物农药的潜质. 以分 离自上海周边地区 12种植物根际的 104 株荧光假单胞菌为研究对象 ,进行了表型分类 ,并采 用 16 S - rDNA RFL P和 R EP - PCR 技术 ,系统地研究了荧光假单胞菌的遗传多样性. 结果表 明: 16 S - rDNA RFL P酶切图谱聚类分析在 85%相似性水平上 ,可将供试菌株划分为 9 群 ; R EP - PCR 指纹图谱聚类分析在 76%相似性水平上 ,可将供试菌株划分为 26 群 ,说明上海地 区的荧光假单胞菌具有丰富的遗传多样性 ;聚类分析结果还显示出菌株间亲缘关系与其分离 地和所在植物具有相关性 ,表明环境条件对荧光假单胞菌的发育和遗传分化有重要影响. 关键词 : 荧光假单胞菌 ; 16 S - rDNA PCR - RFL P; REP - PCR ;遗传多样性 中图分类号 : Q939 　　文献标识码 : A 　　文章编号 : (2008) 02 018207 0　引　言 荧光假单胞菌 ( P seud om onas f lu orescens) 是一类广泛分布于土壤中的革兰氏阴性细菌. 它是一种 ( ) 植物根际促生细菌 p lan t grow th - p romoting rh izobacteria,简称 PGPR ,能产生有效铁载体 、抗生素 、胞外 水解酶和 HCN 等抑菌代谢产物 ,有效地保护植物根系免受病原微生物的侵害 [ 1, 2 ] . 在维持植物根际平 衡 、防治农作物疾病方面起着重要的作用 [ 3～5 ] . 目前 , 由于缺乏有效分型方法准确鉴定该菌 ,荧光假单胞菌的抑菌机制 、筛选依据等尚未完全阐明. 传统分型方法不适于该菌的分型 ,因为荧光假单胞菌各菌株表型特征 ,如生物学特性 、表面抗原等无明 显差异. 随着基因技术的发展 , 16 S - rDNA RFL P及 REP - PCR 技术可以检测出不同细菌 DNA 分子细 微的差异 ,具有分辨率高 、重复性好的特点. 本研究利用分子生物学技术 ,对上海周边地区不同土壤环境中的 12种植物根际的 500 多株产荧光 的假单胞菌进行分离筛选 ,建立菌株的指纹图谱 ,并进行基因分型. 旨在揭示上海地区荧光假单胞菌的 表型和遗传型多样性特征 ,丰富和保存荧光假单胞菌多样性的基因库 ,为优 良菌株的选育提供种质资 源 ,也为进一步研究上海地区荧光假单胞菌的系统分类地位奠定基础. 1　材料与方法 1. 1　培养基 富集培养基 : KA 培养基 、KB 培养基 ; 生长培养基 : LB 培养基 、肉汁胨培养基 ; 鉴定培养基 :脓青素 培养基 、明胶培养基 、水解淀粉培养基等. 　　　　　　　　　　 收稿 日期 : ( ) ( ) 基金项 目: 上海市科委重大项 目 04D Z19304 , 05D Z22327 ;上海市教委重点