3章 第3节 原核和真核染色体结构.ppt

串联基因簇Tandem (串连) gene clusters: rDNA: 45S precursor (18,5.8 28S) – 10-10000 copies (human: ca. 5x40); histone genes: 100. 中度重复序列 (10-100/1000 level) 分散重复DNA(Dispersed (分散) repetitive DNA): e.g. Alu and L1 elements. 单一序列DNA Dispersed repetitive DNA: Human Alu elements: 300bp, 300000 –500 000 copies of 80-90% identity L1 element: Alu and L1: almost 10% of human genome. Transposition (转座), as selfish or parasitic DNA, role in evolution Highly repetitive (高度重复): Satellite DNA (卫星DNA) Mouse genome DNA Satellite DNA: 30% GC EcoR I: 234bp band Repeats: GAAAAA(A/T)(G/C)T 5’ – ATAAACTATAAACTATAAACT – 3’ 3’ – TATTTGATATTTGATATTTGA – 5’ Drosophila virilis satellite DNA repeat (several million copies) n ACAAACT, 1.1x107 bp, 25% genome ATAAACT, 3.6x106 bp, 8% genome ACAAATT, 3.6x106 bp, 8% genome AATATAG, cryptic Satellites comprise more than 40% of the genome （三）、遗传多态性 同一种类的不同染色体或不同个体之间的某一染色体的相同区域，由于基因或染色体基因座上的碱基变化(突变)能使该基因座产生多种形式(多形体)，称为基因的多态性。基因的多态性可以描述单个个体中单拷贝基因的不同突变遗传因子。包括单核苷酸多态性(SNP)和简单序列长度多态性(SSLP)，其中SNP可创造或破坏限制酶的识别序列，结果产生了限制性片段长度多态性(RFLP)。 图. 沉积物总DNA浓度梯度PCR扩增结果 图. 海水样品真细菌文库中克隆的16S rDNA RFLP结果 Fig.3-2 Result of 16S rDNA RFLP ofthe clones from the seawater sample ● 基因组很小，大多只有一条染色体 ● 结构简炼,一般不具有核小体结构； ● 存在转录单元(trnascriptional operon) 多顺反子(polycistron) ?X174 D-E-J-F-G-H mRNA 蛋白J、F、G H D E E.coli 色氨酸操纵子 9个顺反子 9个酶 1、原核生物基因组结构特点 五、原核生物和真核生物基因组结构特点比较 ● 有重叠基因（Sanger 发现） 基因内基因 部分重叠基因 一个碱基重叠 2、真核生物基因组结构特点 ●真核基因组结构庞大 3×109bp、染色质、核膜 ●单顺反子 ●基因不连续性 断裂基因（interrupted gene）、内含子(intron)、 外显子(exon) ●非编码区较多 多于编码序列(9:1) ● 含有大量重复序列 ■ 高度重复序列：拷贝数达到几百个到几百万个。 ●卫星DNA：A ? T含量很高的简单高度重复序列。 * 　动粒(ki`netochore) 　　动粒是由着丝粒结合蛋白在有丝分裂期间特别装配起来的、附着于主缢痕外侧的圆盘状结构，内侧与着丝粒结合，外侧与动粒微管结合。每一个中期染色体含有两个动粒,位于着丝粒的两侧。 　　哺乳动物的动粒可分为三个不同的区域: 即内层、中间层和外层, 直径约为200nm。中间层(middle layer)染色浅, 它将内层和外层隔开，中间层有一些纤维，它起着联系内外两层结构的桥梁作用; 内层(inner layer)是染色质的特化层, 它附着在着丝粒