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4thday质粒的提取与电泳.ppt

发布:2017-05-10约2.96千字共20页下载文档
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质粒DNA与基因组DNA的区别 (7) 12,000 转/分离心8min。 弃上清,室温干燥质粒DNA 5-10min。 (去除RNA) (8)用20?l含RNase的水溶解质粒DNA, 轻轻吹打混合。 37 ℃保温10min * * 上次实验小结 1、观察自己组的实验结果:转化平板 *培养板在37C 培养12-16h 卫星菌:培养时间过长 2、实验中的难点 *制备效率高的感受态细胞 o 目的 DNA片段 质粒 TA载体 连接 重组质粒 目的 DNA 转化 无质粒的E.Coli 死亡 有质粒的E.Coli 存活 含抗生素培养基中生长 重组质粒的鉴定 PCR 开始上课时介绍2-3min 平板筛选 小量制备质粒和电泳分析 实验四 开始实验操作前:本次实验介绍10-15min 质粒…… 质粒载体 是存在于细菌染色体外的小型闭合环状双链DNA分子,在宿主细胞内可独立自主复制并赋予宿主细胞一定的遗传性状 筛选标记 MCS(多克隆位点) 复制原点 质粒 1)培养细菌使质粒扩增; 2)收集裂解细菌; 3)分离纯化质粒DNA。 质粒提取原理: 质粒提取有多种方法,但都包含有3个基本步骤: √去除蛋白质 √去除基因组DNA √去除RNA *酚-氯仿抽提法 *RNase消化 ??? 大肠杆菌遗传物质 1、部位不同: 2、大小不同: 质粒分子量较小,大小只有普通细菌染色体DNA的百分之一。 基因组DNA分子量较大,细菌基因组约含3000个基因,5?106 bp。 基因组DNA容易断裂线性化 碱裂解法提取质粒的原理 原理: 1、强碱和SDS裂解细菌,细菌中的质粒或基因组DNA在碱性条件下发生变性。 2、怎样去除基因组DNA? 当加入酸性物质进行中和时,质粒DNA很快复性, 染色体DNA则和变性蛋白质等缠绕在一起难以复性而形成沉淀,经离心随细胞碎片一起去除; 3、怎样去除蛋白质? (已经学过) 留有质粒DNA的上清,经酚和氯仿去除蛋白质后, 用乙醇沉淀质粒DNA,即得到质粒DNA. 1) 细胞悬浮液(溶液I)--悬浮菌体 50 mmol/L 葡萄糖 25 mmol/L Tris.Hcl PH 8.0 10 mmol/L EDTA.Na2 PH 8.0 2) 细菌裂解液(溶液II) --裂解菌体 0.2mol/L NaOH 1% SDS 碱裂解法提取质粒试剂: 3)中和液(溶液III) ----中和NaOH 60 ml 5mol/L 醋酸钾 11.5ml 冰醋酸 28.5ml 水 4)20mg/ml RNase----降解细菌RNA 工作浓度30~50 ? g/ml 其他试剂作用和成分同实验一。 质粒DNA的制备 录像5分钟:(8:20~8:25) (1)(细菌的收获:) 取1.5 ml 工程菌液6,000转/分,离心2min, 弃上清。 (2)(细菌的裂解:) 加入200?l预冷的细胞悬浮液(溶液I)悬浮细菌 加入200?l细菌裂解液(溶液II), 颠倒混合离心管内容物,待溶液变粘稠为止。 注: 粘稠 :开盖后出现拉丝现象,证明DNA已经游出。 (3)(中和:)加入150?l中和液,上下颠倒混合后置 冰上 5min, 12,000转/分, 4℃离心 5min。 碱裂解法提取质粒操作步骤 开始操作: (去除蛋白质) (4) 将上清移至另一离心管中(注意不要混入白色沉淀物),加入等体积的TE饱和的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)混和液,振荡混匀1min,12,000转/分离心 5min。 (5)将上层水相移至另一离心管中,加入等体积的氯仿/异戊醇(24:1)溶液,振荡混匀1min, 12,000转/分 离心 5min 。 (沉淀DNA) (6)将上层水相移至另一离心管中,加入2.5倍体积的无水乙醇, 置-20℃沉淀10-15 min。 1 继续提取质粒: 获取及溶解沉淀的质粒DNA 2 质粒DNA电泳分析: 20 ?l质粒DNA溶液 取出10 ?l放于另一个离心管中备用 剩余10 ?l用于下一步酶
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