生化实验论文-转基因产品检测 核酸提取纯化.doc
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《生化实验技术与应用》
综合设计性实验
实验论文
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大豆基因组DNA的提取与分离鉴定摘要:DNA。同时掌握提取植物组织基因组DNA的基本方法、紫外分光光度法测定DNA含量的原理和方法、DNA的水平式琼脂糖凝胶电泳操作、高速冷冻离心机等仪器设备的使用。
关键词:DNA;提取鉴定PCR;琼脂糖凝胶电泳1 前言核酸是生物有机物体重的重要组成成分,在生物体中核酸常与蛋白质结合在一起。核酸分为DNA和RNA两大类,前者主要存在于细胞核内,后者要存在于细胞质及核仁里。在制备核酸时,通过研磨破坏细胞壁和细胞膜,使核蛋白被释放出来。苯酚可使蛋白质变性,蛋白质溶于酚相,DNA则溶于上层水相。将氯仿与苯酚混合使用,可减少酚相中因水的存在而造成DNA的少量溶解。95%乙醇可使核酸从水相中沉淀出来,用70%的乙醇洗涤可以除一些盐分,经Rnase解RNA,可得较纯的DNA。DNA含量与纯度测定,目前常用紫外吸收法,利用核酸在260nm有吸收峰,根据公式[DNA(μg/mL)=A260*50*稀释倍数可计算出核酸DNA的浓度。由于蛋白质在280nm有吸收峰,可根据比值判断DNA纯度:A260/A280<1.8时,表明蛋白质含量偏高;1.8<A260/A280<1.9时,表明样品较纯;A260/A280>2.0时,表明RNA或DNA碎片较多。
DNA的原理为:在强酸、加热条件下,可以使DNA中的嘌呤碱基与脱氧核糖间的糖苷键断裂,产生嘌呤碱基、脱氧核糖与嘧啶核苷酸。其中,2’-脱氧核糖在酸性环境中成为w-羟基-r-酮基戊醛,此物与二苯胺反应生成蓝色化合物,在595nm处有最大吸收。DNA在40-400ug范围内光吸收值与DNA含量成正比。
在转基因技术中,外源基因导入到植物体中时,通常使用花椰菜花叶病毒CaMV35S启动子启动下游编码基因的转录。在染色体中,一个转录单位由启动子序列,编码序列和终止序列组成,常用终止序列是胭脂碱合酶(NOS)CaMV35S启动子或NOS终止子序列进行分析,即可定性分析植株体是否为转基因品种。本文以上述所提取出的大豆基因组为模板,采用PCR技术(聚合酶链式反应)大量扩增CaMV35S启动子序列,同时采用大豆品种特异性基因Lectin作为内参基因,可对所提取的基因组进行质量评价。经过琼脂糖凝胶电泳,检测PCR产物片段大小,若成功扩增得到CaMV35S启动子序列,其大小应该是195bp,而Lectin片段大小为118bp。结合此实验结果,可初步对所研究大豆品种是否含有转基因成分。预进一步对结果进行确证,可通过其他辅助证据加以证明,如对PCR扩增产物进行限制性内切酶分析,测序分析,结合可溯源的阳性对照品种等试验结果等。
电泳是荷电溶质或粒子在电场作用下发生定向泳动的现象。核酸的分离和鉴定通常采用琼脂糖凝胶电泳。
不同大小、不同形状和不同构象的DNA 分子在相同的电泳条件下(如凝胶浓度、电流、电压、缓冲液等),有不同的迁移率,所以可通过电泳使其分离。琼脂糖凝胶电泳分离后的DNA可用溴化乙啶(EB)254nm波长紫外光照射下,呈现橙黄色的荧光。
2 材料与方法
2.1 材料与设备2.1.1 实验材料2.1.2 试剂及配制方法基因组DNA的提取和纯化
1.淀粉酶(可选),1500单位/mg-3000单位/mg蛋白质
2.三氯甲烷(CHCl3)
3.98%乙醇(C2H5OH)
4.乙二胺四乙酸二钠盐 Na2EDTA(C10H14N2O8Na2)
5.CTAB(C19H42BrN)
6.37%盐酸(HCl)
7.异丙醇(CH3CHOHCH3)
8.蛋白酶K(可选),冷冻状态下约50单位/mg
9.RNA酶(可选),不含DNA酶,冷冻状态下约50单位/mg
10.氯化钠(NaCl)
11.氢氧化钠(NaOH)
12.TRIS(C4H11NO3)
13.淀粉酶溶液(可选)淀粉酶10mg/ML,不要灭菌。-20摄氏度保存,避免反复冻融
14.CTAB-1提取缓冲液(PH8.0)
称取4.00gCTAB,16.38g氯化钠,2.42gTRIS,1.50gNa2EDTA,4.00gPVP-40,用适量水溶解后,调节PH,定容至200ml,高压灭菌。临用前按使用量加入巯基乙醇,使其终浓度为2%。
15.CTAB-2提取缓冲液(PH8.0)
称取4.00gCTAB,16.38g氯化钠,2.42gTRIS,1.50gNa2EDTA,用适量水溶解后,调节PH,定容至200ml,高压灭菌。
16.CTAB沉淀
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