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食品中过敏原成分环介导等温扩增(LAMP)检测方法 第21部分:胡萝卜(征求意见稿).doc

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前 言 SN/T ××××的总题目是,由下列部分组成: 1部分:开心果 第2部分:胡桃 第3部分:腰果 第4部分:榛子 第5部分:杏仁 第6部分:巴旦木 第7部分:巴西坚果 第8部分:澳洲坚果 第9部分:栗子 第10部分:羽扇豆 第11部分:葵花籽 第12部分:芝麻 第13部分:芥末 第14部分:花生 第15部分:大豆 第16部分:小麦 第17部分:大麦 第18部分:荞麦 第19部分:牛奶 第20部分:虾 第21部分:胡萝卜 第22部分:芹菜 本部分为SN/T ××××的第××部分。 本部分按照GN/T 1.1-2009给出的规则起草。 请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任。 本部分由国家认证认可监督管理委员会提出。 本部分由全国进出口食品检测标准化技术委员会(SAC/TC445)归口。 食品中成分环介导等温扩增(LAMP)检测方法 第1部分:范围 GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法 GB/T 27403 实验室质量控制规范 食品分子生物学检测 胡芦菔,红萝卜又称甘荀,Apiaceae)胡萝卜属(Daucus L.)。 。 ITS1-5.8SRNA-ITS2基因特异性检测引物进行LAMP扩增,通过颜色变化观察判定是否存在过敏原胡萝卜成分。 LAMP检测方法 原理 根据胡萝卜ITS1-5.8SRNA-ITS2基因序列设计特异性内引物、外引物各一对,特异性识别靶序列上的六个独立区域,利用Bst DNA聚合酶启动循环链置换反应,在胡萝卜ITS1-5.8SRNA-ITS2特异靶序列启动互补链合成,在同一链上互补序列周而复始形成有很多环的花椰菜结构的茎-环DNA混合物;从dNTP析出的焦磷酸根离子与反应溶液中的Mg2+结合,产生副产物(焦磷酸镁)形成乳白色沉淀, 加入显色液,即可通过颜色变化观察判定结果。显色液显色原理:SYBR Green I是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。在游离状态下,SYBR Green I发出微弱的荧光,但一旦与双链DNA结合后,荧光大大增强。因此,SYBR Green 的荧光信号强度与双链DNA的数量相关,可以根据荧光信号检测出LAMP反应体系存在的双链DNA数量。 仪器和设备 超纯水发生器(分子生物学级别)。 水浴锅或加热模板:65 ℃±1 ℃和80 ℃±1 ℃。 离心管:0.1 mL、1.5 mL。 计时器。 移液枪:量程0.5 μL~10 μL、量程10 μL~100 μL、量程100 μL~1000 μL。 除另有规定外,所有分析纯或生化试剂。实验用水:应符合GB/T 6682中一级水的规格。 dNTPs溶液:每种核苷酸浓度25mmol/L。 Bst DNA聚合酶:酶浓度8 U/μL。 10×ThermolPol缓冲液:含200 mmol/L Tris-HCl(pH 8.8)、100 mmol/L硫酸铵、100 mmol/L 氯化钾、20 mmol/L硫酸镁、1% Triton X-100。 硫酸镁溶液:100 mmol/L。 甜菜碱:5 mol/L。 显色液:SYBR Green I 荧光染料,1000 ×。 引物:根据胡萝卜ITS1-5.8SRNA-ITS2基因设计一套特异性引物,包括外引物F3/B3,内引物FIP/BIP,见表1。 表1 引物序列名称 编号 序列 LAMP引物序列 5’- GAAATTGGCCTCCCGTGC -3’ 外侧下游引物(B3) 5’- GCTTAAACTCAGCGGGTAGT -3’ 内侧上游引物(FIP) 5’- AACCACCGATGTCGCGATGCCTTTTGTGTGCGGTTGGC -3’ 内侧下游引物(BIP) 5’- GTCGTTGTGTATACCCGCCGCGGGTCACAATCGAAGTGCA -3’ 上游环引物(LF) 5’- CGTCACCAGAGACTCATTTTTGA -3’ 下游环引物(LB) 5’- GGCCCTTGGGCACAGCAAA -3’ 实验步骤 阴性对照、阳性对照和空白对照的设置 阴性对照:采用不含有待测基因序列的植物基因组DNA为模板。——提取DNA时设置的提取空白对照(以水代替样品); ——LAMP反应的空白对照(以DNA溶解液代替DNA模板)。反应体系见表。μL显色液滴在管盖内侧,盖管盖时应小心,防止显色液混合进入反应液中。 表LAMP反应体系 工作液浓度 加样量(μL) 反应体系终浓度 缓冲液 × 2.5 1 × 外侧上游引物(F3) 10 μmol/L 0.3 0.12 μmol/L 外侧下游引物(B3) 10 μmol/L 0.3 0.12 μmol/L 内侧上游引物(FIP) 1
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