数量遗传基本：第三章有限大小的群体和近交.pdf

第一、二章内容要点 基因型频率，基因频率 自交和回交的遗传效应 随机交配（Random mating ） Hardy-Weinberg平衡及其检验 隐性有害基因携带者的比例 影响群体结构的原因 系统过程（systematic process ） 分散过程（dispersive process ） 第一、二章内容要点 连锁（Linkage ） A （A1 ，A2 ）—B （B1，B2 ），重组率r 相引连锁（Linkage in coupling ） • A1B1 ，A2B2 ，(1-r)/2 互斥连锁（Linkage in repulsion ） • A1B2 ，A2B1 ，r/2 连锁不平衡（Linkage disequilibrium ） 第一、二章内容要点 配子别不平衡（Gametic phase disequilibrium ） 等位基因和频率 A ，p A ，q B ，p B ，q 1 A 2 A 1 B 2 B 配子基因型 A B A B A B A B 1 1 1 2 2 1 2 2 平衡频率 p A p B p A qB qA p B qA qB 观测频率 u s t v 连锁不平衡度 +D -D -D +D  不平衡度（Degree of disequilibrium ） D uv −st 注意1：连锁并非一定存在不平衡 随机交配可打破连锁不平衡 D D (1−r)t t 0 0.25 r=0.01 0.20 度 r=0.05 衡 0.15 平 不 r=0.1 锁 0.10 连 r=0.2 0.05 0.00 r=0.3 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 随机交配次数 果蝇，位点A和B，在同一条 染色体，相差17.8kb Haplotype 观测值 观测频率 期望频率 期望值 A B + + 4 0.085 0.06