草类基因表达谱与小RNA测序结合的性状分析.docx

草类基因表达谱与小RNA测序结合的性状分析

目录

草类基因表达谱与小RNA测序结合的性状分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．4

内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

草类基因表达谱的研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

2.1基因表达谱的概念和意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

2.2草类基因表达谱的研究方法和技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

小RNA在植物中的作用机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

3.1小RNA的基本概念．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

3.2小RNA在植物发育过程中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

草类基因表达谱与小RNA测序技术介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

4.1草类基因表达谱与小RNA测序的区别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

4.2主要的草类基因表达谱与小RNA测序工具．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

性状分析的意义和方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

5.1性状分析的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

5.2性状分析的方法和流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

草类基因表达谱与小RNA测序结合的优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

6.1结合优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

6.2结合优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

研究案例分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

7.1案例一．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

7.2案例二．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

草类基因表达谱与小RNA测序结合的性状分析（2）．．．．．．．．．．．．．．22

一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

1.1草类基因表达研究的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

1.2小RNA测序技术在草类基因表达研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．24

研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

二、实验材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

1.1植物材料的选择与采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

1.2样本处理与保存．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.1基因表达谱测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.2小RNA测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.3数据处理与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

三、草类基因表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

基因表达差异分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

1.1差异表达基因的筛选标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

1.2差异表达基因的数量与类别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34