银杏雌雄花芽差异表达基因的分析和性别相关基因的鉴定的中期报告.docx

银杏雌雄花芽差异表达基因的分析和性别相关基因的鉴定的中期报告 本研究旨在分析银杏树雌雄雌芽的差异表达基因并鉴定性别相关基因。该报告为中期进展报告，介绍了已经完成的研究进展和下一步的研究计划。 已完成的工作： 1. 样品采集和RNA提取：从银杏树雌雄植株中分别采集了雌雄芽，通过RNA提取实验成功获得高质量的总RNA样品。 2. 建立文库并测序：从总RNA中筛选出含有完整mRNA的物种，使用Illumina HiSeq平台进行cDNA文库建立和高通量测序，获得了大量的测序数据。 3. 数据处理和差异基因筛选：使用Trimmomatic软件对原始测序数据进行质量控制和过滤，得到高质量的测序数据，然后使用TopHat和Cufflinks软件将测序数据比对到基因组上，计算不同基因之间的差异表达，最终得到候选性差异基因。 4. 实时荧光定量PCR验证：使用实时荧光定量PCR对候选基因进行验证，确定了8个高度差异表达基因作为进一步研究的重点。 下一步计划： 1. 功能分析：运用GO和KEGG数据库对8个差异表达的基因进行功能分类和通路分析，从而进一步探讨差异基因的生物学功能。 2. 性别相关基因鉴定：运用生物信息学方法，结合差异表达基因筛选结果，鉴定潜在的性别相关基因。 3. 相关基因的分子调控机制研究：使用基因转录和蛋白质互作技术研究差异表达基因在银杏雌雄花的形成和性别分化中的分子调控机制。 总之，本研究为银杏树基础研究提供了重要的数据和基础信息，为进一步探索银杏雌雄花发育与性别分化的分子机制提供了重要的理论支持。