小麦三雌蕊突变体幼穗中基因的差异表达分析的中期报告.docx

小麦三雌蕊突变体幼穗中基因的差异表达分析的中期报告 该研究旨在运用RNA-Seq技术分析小麦三雌蕊突变体幼穗中基因的差异表达情况。在样品准备阶段，我们采用Trizol方法从三个突变体花序中提取总RNA，并利用RNeasy Kit进行纯化。利用Agilent 2100 Bioanalyzer检测RNA质量，保证RNA样品质量良好。随后，RNA样本分别进行转录组文库构建并进行Illumina HiSeq 4000测序，得到了高质量的RNA-Seq数据。 首先，我们对测序数据进行了质控，并剔除了低质量序列和接头污染序列，确保数据质量。经过去除低质量序列和未知核苷酸占比过高的序列后，分别得到了三个突变体的幼穗转录组数据。经过比对后，将清洗后的数据与小麦基因参考序列比对，得到了高质量的比对结果。比对率在80%以上，达到了预期效果。 运用DESeq2软件分析了小麦三雌蕊突变体与野生型小麦的基因表达水平的差异，筛选出显著差异表达的基因，并进行了GO功能注释和KEGG通路分析，初步发现差异表达的基因主要涉及到了相关代谢途径、光合作用、荷尔蒙信号传导通路、花器官发育等生物学过程。 目前，我们正在进一步对筛选出的差异表达基因进行验证和深入研究，以期获得新的突破和发现。