野生大麦SOD基因家族的生物信息学解析与功能研究.docx

野生大麦SOD基因家族的生物信息学解析与功能研究

目录

野生大麦SOD基因家族的生物信息学解析与功能研究（1）．．．．．．．．．4

一、内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.2文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.3研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.1.1野生大麦样本采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

2.1.2主要试剂及配制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.1.3主要仪器设备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.2生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

2.2.1数据来源与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.2.2SOD基因家族鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

2.2.3基因结构与保守域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2.4系统发育树构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2.5表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

2.3实验方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

三、结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

3.1野生大麦SOD基因家族成员鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

3.2基因结构与保守域特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

3.3系统发育关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

3.4表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

3.5qRT-PCR验证结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

四、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

4.1SOD基因家族在野生大麦中的潜在作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

4.2比较与其他物种的SOD基因家族．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

4.3研究局限性与未来展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

五、结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

六、致谢．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

野生大麦SOD基因家族的生物信息学解析与功能研究（2）．．．．．．．．26

内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

1.2研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

1.3研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.1SOD基因家族概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.2野生大麦SOD基因家族的进化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.3生物信息学在SOD基