大规模GO注释的生物信息学流程_黄子夏.pdf

第 卷 第 期 （ ） ５１ １ 厦门大学学报 自然科学版 Ｖｏｌ．５１ Ｎｏ．１ 　 　 年 月 （ ） ２０１２ １ Ｊａｎ．２０１２ 　 ＪｏｕｒｎａｌｏｆＸｉａｍｅｎＵｎｉｖｅｒｓｉｔ ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅ 　 　 　 　 　 ｙ 大规模ＧＯ注释的生物信息学流程 ＊ ， ， 黄子夏 柯才焕 陈 军 　 （ ， ） 厦门大学海洋与环境学院 福建厦门 ３６１００５ 摘要： ， 随着新一代测序技术的不断发展 海量的序列数据将为生物学研究者挖掘基因信息提供巨大的资源 信息挖掘 ． ， （ ， ） 的一项重要工作是对序列进行功能注释 其中最重要的功能注释方式是基因本体论 的注释 利用生 ＧｅｎｅＯｎｔｏｌｏ ＧＯ ． 　 ｇｙ 物信息学方法和软件工具集成了针对 序列的大规模 注释流程（ ， ） 该 ＥＳＴ ＧＯ ｌａｒｅｓｃａｌｅＧＯ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｉｅｌｉｎｅ ＬＳＧＡＰ ． － 　 　 　 ｇ ｐｐ 流程集合了 、 以及 等软件和 、 或 等常用蛋白数据库 用户可以将 序列 ＢＬＡＳＴ Ｂ２ ４ ｉｅ Ｗｅ ｏ Ｓｗｉｓｓ ｒｏｔＮｒ Ｉｎｔｅｒｒｏ ． ＥＳＴ ｇ ｐｐ ｇ ｐ ｐ ， 通过此流程最终获得可视化的 分类统计图表 直观地显示基因在不同过程中的参与情况 为了验证 的准确 ＧＯ ． ＬＳＧＡＰ ， （ ）